Simple sequence repeats longer than 24 bp
 
Simple sequence repeats in all sequences
(Top 100 % listed in the order of total length)
(Normalized total lengths [bp / 1 Mbp of DNA sequence] are shown in parentheses after each repeated motif.)
Length of
repeated
motif
(bp)
Taxonomic group
Primates Human chrom. 22 Rodentia Mammalia Vertebrata Arthropoda C. elegans Embryophyta S. 
cerevisiae
Fungi  
1 A (567)
C (1)
A (803)
A (337)
C (8)
A (236)
A (101)
C (5)
A (77)
A (10)
C (3)
A (82)
C (1)
A (92)
A (181)
C (3)
2 AC (655)
AT (128)
AG (98)
AC (598)
AT (110)
AG (66)
AC (2707)
AG (1287)
AT (223)
AC (809)
AG (368)
AT (29)
AC (1016)
AT (359)
AG (177)
AC (95)
AT (63)
AG (35)
AG (83)
AT (82)
AC (49)
AT (283)
AG (113)
AC (13)
AT (144)
AC (32)
AG (4)
AC (42)
AT (13)
AG (12)
3 AAT (55)
AAC (16)
AAG (15)
AGC (9)
ATC (7)
AGG (5)
CCG (5)
ACC (3)
ACT (2)
AAT (72)
AAG (21)
AAC (13)
AGG (7)
ATC (7)
AGC (4)
ACC (3)
CCG (2)
ACT (1)
AAG (178)
AGC (104)
AGG (86)
AAT (84)
ACC (53)
AAC (40)
ATC (12)
CCG (7)
ACT (5)
AGC (28)
AAT (14)
AAC (10)
ACC (7)
AGG (7)
AAT (117)
AGC (32)
ATC (24)
AGG (12)
AAC (7)
ACT (7)
ACC (5)
CCG (5)
AGC (25)
AAC (13)
AAT (13)
ATC (6)
AGG (4)
ACC (2)
ACT (1)
AAG (6)
AAT (5)
AGG (3)
ATC (2)
AAC (1)
ACT (1)
AGC (1)
AAG (52)
AAT (36)
AAC (34)
ATC (14)
AGG (6)
AGC (4)
ACC (2)
ACT (1)
CCG (1)
AAT (92)
ATC (28)
AAC (26)
AAG (24)
AGC (13)
ACT (6)
ACG (5)
AGG (2)
AAT (37)
AAC (29)
AGC (10)
ATC (5)
AAG (3)
AGG (3)
CCG (3)
ACC (2)
4 AAAT (135)
AAAG (115)
AAGG (72)
AGAT (70)
ATCC (38)
AAAC (29)
AATG (11)
ACAT (10)
AGGG (10)
AATC (2)
ACAG (2)
ACCT (2)
ACTC (2)
AACC (1)
AAGC (1)
AATT (1)
AGGC (1)
AAAT (184)
ATCC (128)
AAAG (109)
AAGG (70)
AGAT (53)
AAAC (35)
AATG (16)
ACAT (12)
AGGG (12)
ACAG (6)
ACCT (5)
AACC (3)
AATC (2)
AATT (1)
ACCC (1)
ACGT (1)
AGCT (1)
AGAT (568)
AAAG (310)
AAGG (268)
AAAT (168)
AAAC (89)
ACAT (88)
AGGG (87)
ACAG (82)
ATCC (41)
AATG (30)
AGGC (25)
AACC (17)
AAGC (10)
ACGC (10)
AATC (9)
ACCT (7)
AAGT (5)
AATT (4)
ACTG (4)
AACT (3)
ACCC (2)
ACGT (2)
AGCG (2)
AGCC (1)
CCCG (1)
AAGG (193)
AAAG (157)
AAAT (63)
AGGG (12)
ACAG (8)
AGAT (316)
ACAG (112)
ACAT (58)
AAAG (42)
AAAT (42)
ATCC (40)
AAGG (26)
ACTC (22)
AGGC (20)
AATC (19)
AATG (11)
AGCC (10)
AAAC (5)
AACC (5)
AGGG (5)
AGAT (14)
ACAT (6)
AGCC (6)
ACTG (5)
AACC (4)
ATCC (3)
AAAT (2)
AATG (2)
ACAG (2)
ACGC (2)
ACGG (2)
AACT (1)
AAGG (1)
ACCG (1)
ACCT (9)
AAAT (6)
AAGT (1)
ATCC (1)
AATG (2)
ACAT (2)
AAAG (1)
AAAT (1)
AGAT (1)
AAAT (5)
AAAT (9)
ACAT (3)
ACCC (3)
AGGC (3)
AAAC (2)
AAAG (2)
AAGT (2)
ACCT (2)
AGAT (2)
5 AAAAC (59)
AAAAT (42)
AAAAG (19)
AGGGG (6)
AAAGG (5)
AAGGG (5)
AATAG (4)
AAGAG (3)
AGAGG (3)
AAACC (2)
AAATG (2)
AAATT (2)
AACAT (2)
AATAC (2)
AATAT (2)
ACCCC (2)
AGCCC (2)
AATGG (1)
ACAGG (1)
AGGGC (1)
ATCCC (1)
CCCCG (1)
AAAAT (68)
AAAAC (65)
AAAAG (22)
AAACC (7)
AAAGG (7)
AGAGG (7)
AAGAG (6)
AGGGG (6)
AAATT (5)
AACAT (5)
AAGGG (4)
AATAC (4)
AATAG (4)
AGGGC (3)
AACAG (2)
AATAT (2)
ACAGG (2)
CCCCG (2)
AAACT (1)
AACAC (1)
ACAGC (1)
ACAGT (1)
ACCCC (1)
ACTAT (1)
ACTGC (1)
AGCCC (1)
AGGCG (1)
ATCCC (1)
AAAAC (135)
AAAAG (69)
AAGAG (56)
AGAGG (53)
AGCTC (49)
AAAGG (32)
AAACC (28)
AAAAT (26)
AAGGG (24)
AGGGG (18)
AGAGC (10)
AAAGC (9)
AACCC (8)
AGCCC (8)
ACAGG (6)
AACTG (5)
AATAT (5)
ATCCC (5)
ACACC (4)
ACAGC (4)
ACGAG (4)
AAGAC (3)
AAGTG (3)
AATAG (3)
ACCTC (3)
AGGCC (3)
AGGGC (3)
ATATC (3)
ACACT (2)
AACAC (1)
AACCG (1)
AATCT (1)
ACCTG (1)
AGCAT (1)
AGGCG (1)
CCCCG (1)
AAAAT (24)
AGAGG (19)
AGCCC (18)
AAAAC (17)
AAAGG (15)
AACTG (14)
AATAT (10)
AGCTC (7)
AAGGG (44)
AGAGG (42)
AAAAT (37)
AAAGG (21)
AATAT (14)
AGCGG (10)
AAAAC (9)
AATAG (7)
AATCT (6)
AATTC (6)
AATCC (5)
AGCTC (5)
AGGGG (5)
CCCCG (5)
CCCGG (5)
AACCT (7)
AAACC (4)
ACCAT (4)
AACAG (3)
AACTG (3)
ACTCC (3)
ATCCC (3)
AAAGC (2)
AAATT (2)
AAGGG (2)
AATAC (2)
AATCC (2)
AAAAC (1)
AAAAT (1)
AAAGT (1)
AAATG (1)
AACCC (1)
AACCG (1)
AATAG (1)
AATCG (1)
ACAGG (1)
ACGAT (1)
ACTAT (1)
ACTGC (1)
AGCCC (1)
AGGGC (1)
ATATC (1)
ATCCG (1)
ATCGC (1)
ATGCC (1)
AAATT (4)
AAAAT (1)
AAATC (1)
AATAC (1)
AATAT (1)
AAAAC (3)
AAAAG (2)
AGAGG (2)
AAAAT (1)
AAACC (1)
AAACG (1)
AAATT (1)
AACCC (1)
AACTC (1)
AAGAG (1)
AATAT (1)
AATCC (1)
AATTC (1)
ACCCC (1)
ACCCG (1)
ACGAT (1)
ACGGC (1)
AGAGC (1)
AGGGG (1)
ATATC (1)
ATGCC (1)
AACAC (6)
AGATG (6)
AAAAC (3)
AAAAG (3)
AATAC (2)
AAATT (8)
AAAAT (6)
AAAAC (4)
ACTAT (4)
AAACC (3)
AAAGC (3)
AAACT (2)
ATCCC (2)
AAAAG (1)
AATAG (1)
AATAT (1)
ACTCT (1)
AGGGG (1)
ATGCC (1)
6 AAAAAC (6)
AGATAT (5)
AGAGGG (4)
AAAAAT (2)
AACCCT (2)
AAGGAG (2)
AAAAAG (1)
AAATAC (1)
AAATAT (1)
AAGGGG (1)
ACATAT (1)
ACCATC (1)
AGCCCC (1)
CCCCGG (1)
AAAAAC (8)
AGAGGG (6)
AGATAT (3)
AAAAAG (2)
AAAAAT (2)
AAATAC (2)
ACACAT (2)
AGCCCC (2)
AAAACC (1)
AACCCC (1)
AACCCT (1)
AAGGAG (1)
ACACAG (1)
ACAGGG (1)
ACATAT (1)
ACCAGC (1)
ACCATC (1)
ACCCTG (1)
AGAGGC (1)
AGCCGG (1)
AGGGGC (1)
AGGGGG (1)
CCCCCG (1)
CCCGCG (1)
ACAGGC (120)
AGAGGC (111)
AGAGGG (50)
AAGGAG (26)
ACACAG (23)
ACAGAG (23)
AGCCCC (17)
ACATAT (16)
AGATAT (15)
AGGGGC (14)
AAAAAG (12)
AAAAAC (11)
AAAACC (9)
AGCCCT (8)
ACACCC (6)
AGCAGG (6)
AAATAT (5)
AGAGAT (5)
AGCCTC (5)
AGCCTG (5)
AAAGAG (4)
AAAGGG (4)
AAGAGG (4)
AGGGAT (4)
AACCCT (3)
AATGAT (3)
ACACAT (3)
ACCCCC (3)
AGCTCC (3)
AGGGGG (3)
AACTTG (2)
AAGCAG (2)
ACCATC (2)
AGATCG (2)
AGCATC (2)
AAGGCT (1)
AGATCC (1)
AGCGGG (1)
AGGCCC (1)
AGGCGG (1)
AAGGCC (20)
ACACGC (17)
AATAGG (15)
AGAGGC (10)
AAAAAC (8)
ACACCC (8)
ACAGCC (8)
AGAGCG (8)
AATCCC (13)
AGCTCC (12)
AATAGT (10)
AACCCT (5)
AATCTG (5)
ACAGAT (9)
ACTGAT (5)
AATTAC (4)
AATACT (3)
AATATG (3)
AACAGT (2)
AAACCC (1)
AAATGC (1)
AACAGC (1)
AACTGC (1)
AATCCG (1)
AATCTG (1)
ACAGGG (1)
ACCATC (1)
ACCCAT (1)
ACCTGG (1)
ACGCTG (1)
AGAGCC (1)
AGCTCC (1)
ATCCCG (1)
ATGCCC (1)
AAGCCT (63)
AGGCAT (16)
AGCCTG (14)
ACCTAG (7)
ACCTAT (7)
ACATAT (6)
AAAAAT (3)
AAAGCC (2)
AAGTCT (2)
ACCAGG (2)
AAACCT (1)
AAATTC (1)
AAATTG (1)
AAGCCC (1)
AGAGAT (1)
AAGGAG (3)
ACTGAG (2)
AGCCTG (2)
AAAAAC (1)
AAAAAT (1)
AAAATG (1)
AAAATT (1)
AAAGCC (1)
AACAAG (1)
AAGCAG (1)
AATCAC (1)
ACATAT (1)
ACCATC (1)
ACCGGC (1)
ACCTCC (1)
ACGTCC (1)
ACTCTC (1)
AGAGGC (1)
AGATAT (1)
AGGGGC (1)
ACACCC (9)
AACAGC (8)
AATCAT (8)
AAAAAC (7)
AACAAG (6)
ACGATG (4)
AACATG (2)
AAGATG (2)
AAGCTC (2)
AACCCT (60)
AAAAAT (19)
AAAGAG (7)
AACAGC (4)
AACCAG (4)
AAGATG (4)
AACCGC (3)
AATGAT (3)
AGCCTG (3)
AAAAAG (2)
AAGCTC (2)
AAGGAG (2)
AAGTGG (2)
ACAGGG (2)
ACCCGC (2)
ACTGGC (2)
AGAGCC (2)
AGGGGC (2)

© Tóth, Gáspári, and Jurka (2000)