Simple sequence repeats longer than 24 bp
 
Simple sequence repeats in introns
(Top 100 % listed in the order of total length)
(Normalized total lengths [bp / 1 Mbp of DNA sequence] are shown in parentheses after each repeated motif.)
Length of
repeated
motif
(bp)
Taxonomic group
Primates Rodentia Mammalia Vertebrata Arthropoda C. elegans Embryophyta S. 
cerevisiae
Fungi  
1 A (643)
A (379)
A (178)
A (103)
A (82)
A (13)
C (3)
A (70)
A (381)
A (555)
2 AC (631)
AT (93)
AG (84)
AC (2996)
AG (1375)
AT (165)
AC (857)
AG (162)
AT (54)
AC (1378)
AT (341)
AG (223)
AC (140)
AG (94)
AT (90)
AT (116)
AG (65)
AC (56)
AT (308)
AG (195)
AC (18)
AT (555)
AC (380)
AT (84)
AG (26)
3 AAT (61)
AAC (17)
AGG (10)
AAG (8)
ATC (6)
ACC (5)
ACT (5)
AAG (237)
AAT (124)
AGG (109)
AGC (65)
ACC (47)
AAC (43)
ATC (10)
ACT (9)
AAC (49)
AAT (148)
AAC (27)
AAT (54)
AGC (20)
AAT (6)
AAG (4)
AGG (3)
ATC (1)
AAT (69)
AAG (34)
AAC (17)
ATC (10)
ACT (9)
AGG (4)
AAT (168)
AAT (375)
AGC (62)
AAC (42)
ATC (39)
4 AAAT (176)
AAAG (95)
AAGG (65)
AGAT (58)
ATCC (37)
AAAC (31)
AATG (7)
AACC (5)
AATC (5)
AGGG (5)
ACAT (2)
ACCT (2)
AGGC (2)
AAAG (373)
AAGG (285)
AGAT (236)
AAAT (190)
ACAT (127)
ACAG (112)
ATCC (103)
AGGG (84)
AAAC (83)
AAGC (26)
AATG (25)
AACC (18)
ACGC (18)
AATC (17)
ACCC (10)
AGGC (10)
AGCG (9)
ACTG (8)
CCCG (8)
AAGG (140)
AGGG (59)
AAAT (43)
AGAT (297)
ACAG (115)
AATC (79)
ACTC (67)
AAAG (61)
AAAT (61)
ATCC (51)
AAAC (21)
AACC (21)
AGGG (21)
ACAT (19)
AAGG (17)
ACCT (16)
AAAT (11)
AAAC (1)
AAAG (5)
ACAT (4)
- ACCC (52)
5 AAAAC (70)
AAAAT (40)
AAAGG (13)
AGAGG (11)
AAAAG (10)
AGGGG (5)
ACCAG (4)
AAACC (3)
AAGGG (3)
ACTCC (3)
CCCCG (3)
ACTGC (2)
AAATT (1)
AATAG (1)
ACCCC (1)
AGGGC (1)
AAAAC (83)
AAAAG (77)
AGGGG (76)
AAAAT (58)
AGAGG (40)
AAACC (29)
ACAGC (27)
AGCTC (26)
ACCTC (19)
AGCCC (19)
AGAGC (17)
AATAT (16)
AACCC (14)
AAGAG (13)
AAGGG (9)
ATATC (9)
AGAGG (94)
AAAAC (81)
AACTG (67)
AATAT (47)
AAAAT (19)
AAATT (15)
ATCCC (15)
ATCCG (15)
AAATT (7)
AAAAT (3)
AAATC (1)
AAGGT (1)
AATAC (1)
AATAT (1)
AGCCT (1)
AAAAC (5)
AAAAG (5)
ATGCC (5)
AAACG (4)
AATTC (4)
ACGAT (4)
AACAC (39)
AAAAC (33)
AGGGG (23)
6 AGATAT (9)
AAAAAC (7)
AGAGGG (5)
ACCATC (4)
AAATAT (3)
ACATAT (3)
AGCCCC (3)
AAAAAT (2)
AAATAC (2)
AAGAGG (2)
AAGGAG (2)
AAGGGG (2)
AGAGGC (108)
ACATAT (44)
AAGGAG (36)
AAAAAC (27)
AGAGAT (27)
ACAGAG (26)
AGATAT (26)
AGCCCC (21)
ACACAT (19)
AACCCT (15)
AATGAT (15)
ACACAG (12)
AGATCG (12)
AAAGAG (9)
AGAGGC (49)
AAAAAC (40)
ACACCC (40)
ACAGCC (40)
AATAGT (41)
ACTGAT (94)
AATACT (36)
ACGCTG (18)
AAGCCT (68)
ACCTAG (21)
AGCCTG (5)
AGGCAT (5)
AAACCT (2)
AAAGCC (2)
ACATAT (2)
AAAATT (1)
AAGACT (1)
AAGCCC (1)
ACACCT (1)
AAAATT (6)
AATCAC (6)
AAAATG (5)
AAAAAC (70)
AATCAT (47)
AAAAAT (56)
ACAGGG (39)
AAAAAG (34)
AGGGGC (34)

© Tóth, Gáspári, and Jurka (2000)