Simple sequence repeats longer than 24 bp
 
Simple sequence repeats in intergenic regions
(Top 100 % listed in the order of total length)
(Normalized total lengths [bp / 1 Mbp of DNA sequence] are shown in parentheses after each repeated motif.)
Length of
repeated
motif
(bp)
Taxonomic group
Primates Rodentia Mammalia Vertebrata Arthropoda C. elegans Embryophyta S. 
cerevisiae
Fungi  
1 A (650)
A (414)
C (20)
A (337)
A (174)
C (14)
A (140)
A (12)
C (6)
A (131)
C (2)
A (162)
A (399)
C (9)
2 AC (654)
AT (130)
AG (102)
AC (2868)
AG (1440)
AT (228)
AC (1754)
AG (914)
AT (55)
AC (1471)
AT (574)
AG (158)
AC (188)
AT (186)
AG (72)
AG (119)
AT (99)
AC (76)
AT (481)
AG (154)
AC (25)
AT (455)
AC (121)
AG (20)
AC (59)
AG (25)
AT (21)
3 AAT (66)
AAG (18)
AAC (12)
CCG (9)
AGC (6)
AGG (6)
ATC (4)
ACC (3)
ACT (1)
AAG (245)
AAT (122)
AGG (70)
ACC (63)
AAC (45)
AGC (38)
ATC (20)
CCG (9)
AGC (51)
AAT (44)
AAT (143)
ATC (53)
AGC (36)
AGG (34)
AGC (56)
AAC (55)
AAT (16)
AAG (7)
AAT (7)
ACT (4)
ATC (2)
AAC (1)
AGC (1)
AGG (1)
AAG (73)
AAT (67)
AAC (17)
ATC (8)
AGG (5)
ACC (2)
AAT (206)
ATC (30)
ACT (20)
AAC (8)
AGC (8)
AAC (35)
AAT (18)
AGG (9)
ATC (7)
AAG (5)
ACC (5)
4 AAAT (159)
AAAG (116)
AAGG (72)
AGAT (60)
ATCC (41)
AAAC (33)
AATG (17)
ACAT (15)
AGGG (6)
AATC (3)
ACTC (3)
AAGC (2)
ACAG (2)
AATT (1)
ACCT (1)
AGGC (1)
AAAG (305)
AAGG (284)
AAAT (206)
AGAT (198)
AAAC (141)
AGGG (80)
ACAG (78)
ACAT (64)
AATG (54)
ATCC (40)
AACC (26)
AGGC (19)
ACCT (16)
AACT (11)
AAGC (8)
AATC (5)
ACGC (4)
ACTG (4)
AGCC (4)
AAGG (455)
AAAG (281)
AAAT (99)
ACAG (24)
AGAT (599)
ACAG (162)
ACAT (81)
AAGG (73)
ATCC (54)
AATG (31)
AAAT (27)
ACTC (17)
ACAG (19)
AGCC (19)
AACC (12)
AACT (8)
ACCT (7)
AAAT (6)
AAGT (3)
ATCC (1)
AGAT (4)
AAAG (2)
AAAT (2)
AAAT (15)
AAAT (9)
AGGC (8)
AAGT (7)
AAAC (5)
AAAG (5)
ACCT (5)
AGAT (5)
5 AAAAC (58)
AAAAT (48)
AAAAG (22)
AAGAG (9)
AAGGG (5)
AAATG (4)
AAAGG (3)
AATAT (3)
ACCCC (3)
ATCCC (3)
AATAC (2)
AATAG (2)
AGCCC (2)
AGGGG (2)
CCCCG (2)
AAACC (1)
AAAGC (1)
AAATT (1)
AACCG (1)
ACAGG (1)
AAAAC (173)
AAGAG (111)
AAAAG (69)
AGAGG (67)
AAAGG (65)
AAGGG (29)
AAAAT (21)
AAACC (20)
ACAGG (18)
AGCTC (17)
AACTG (15)
ATCCC (12)
AGGCC (9)
AATAG (8)
ACACC (7)
ACACT (6)
ATATC (6)
AACAC (4)
AGGCG (4)
AGGGC (4)
AGGGG (4)
AAAGG (47)
AGCCC (34)
AAGGG (125)
AGAGG (120)
AAAAT (91)
AAAGG (60)
AATAT (39)
AGCGG (29)
AAAAC (26)
AATCT (18)
AGCTC (13)
AGGGG (13)
CCCCG (13)
CCCGG (13)
AAGGG (14)
AATCC (14)
AATAC (11)
AAAGT (10)
ACAGG (8)
AAACC (7)
AAATT (7)
ACGAT (7)
AGCCC (7)
AAATT (5)
AAATC (1)
AAGTC (1)
AATAC (1)
AATAT (1)
AAAAC (5)
AAGAG (4)
AGAGG (4)
AAAAG (2)
AAACC (2)
AAATT (2)
AACCC (2)
AATAT (2)
AATTC (2)
ACCCC (2)
ACCCG (2)
ACGGC (2)
AGGGG (2)
AACAC (18)
AAAAC (8)
AAAAG (8)
AGATG (8)
AAATT (18)
AAAAT (13)
ACTAT (11)
AAAGC (10)
AAACC (9)
AAACT (5)
ATCCC (5)
AAAAG (4)
AATAG (4)
AATAT (4)
ACTCT (4)
ATGCC (4)
6 AAAAAC (4)
AAAAAT (4)
AGAGGG (4)
AGATAT (4)
CCCCGG (3)
AGCCCC (2)
AAAAAG (1)
AAAGGG (1)
AAATAC (1)
AACCCC (1)
AAGGAG (1)
AAGGGG (1)
ACAGAG (1)
ACCCCC (1)
ACCGCC (1)
ATCCCG (1)
CCCCCG (1)
CCCGCG (1)
AGAGGC (104)
AGAGGG (61)
AGGGGC (25)
AAGGAG (18)
ACAGAG (18)
AAATAT (17)
AAAAAG (16)
AGCCCC (14)
AAGAGG (12)
ACACCC (10)
AAAACC (9)
AAAGGG (8)
AACTTG (7)
AAGCAG (7)
AGCATC (7)
ACCATC (5)
AAAAAC (4)
ACACAG (4)
ACATAT (4)
AGATCC (4)
AGGGGG (4)
ACACGC (51)
AGAGCG (26)
AGCTCC (34)
AACCCT (16)
AATCTG (16)
AATTAC (28)
ACAGAT (17)
AACAGT (13)
AATATG (12)
AACAGC (10)
ACCATC (8)
AAGCCT (60)
AGGCAT (34)
ACCTAT (18)
ACATAT (14)
AGCCTG (13)
AAAAAT (7)
AAATTG (2)
AAAACG (1)
AAAGCC (1)
AAATTC (1)
AAATTT (1)
AAGCAT (1)
AAGTCT (1)
AATACT (1)
ACCTAG (1)
AGAGGC (1)
ATCCCG (1)
AAAAAC (2)
AACAAG (2)
AAGCAG (2)
ACATAT (2)
AGATAT (2)
AGGGGC (2)
AACAAG (27)
AAAAAC (15)
ACACCC (11)
AATCAT (9)
AAAAAT (48)
AGCCTG (9)
ACCCGC (6)
AAGGAG (5)
AAGTGG (5)

© Tóth, Gáspári, and Jurka (2000)