Simple sequence repeats longer than 12 bp
 
Simple sequence repeats in all sequences
(Top 100 % listed in the order of total length)
(Normalized total lengths [bp / 1 Mbp of DNA sequence] are shown in parentheses after each repeated motif.)
Length of
repeated
motif
(bp)
Taxonomic group
Primates Human chrom. 22 Rodentia Mammalia Vertebrata Arthropoda C. elegans Embryophyta S. 
cerevisiae
Fungi  
1 A (3418)
C (11)
A (5126)
C (15)
A (1634)
C (205)
A (1291)
C (106)
A (1051)
C (367)
A (875)
C (110)
A (227)
C (201)
A (1221)
C (24)
A (1069)
C (6)
A (872)
C (33)
2 AC (1033)
AT (314)
AG (293)
CG (3)
AC (981)
AT (266)
AG (261)
CG (3)
AC (3468)
AG (1619)
AT (354)
CG (20)
AC (1333)
AG (854)
AT (109)
CG (16)
AC (1496)
AT (616)
AG (334)
CG (3)
AC (825)
AT (340)
AG (235)
CG (3)
AG (222)
AT (170)
AC (163)
CG (1)
AT (648)
AG (333)
AC (85)
CG (1)
AT (494)
AC (67)
AG (19)
AT (133)
AC (81)
AG (58)
3 AAT (161)
AAC (110)
AAG (42)
AGG (42)
CCG (33)
AGC (32)
ATC (26)
ACC (25)
ACT (6)
AAT (211)
AAC (128)
AGG (60)
ACC (56)
AAG (55)
ATC (35)
AGC (32)
CCG (24)
ACT (2)
ACG (1)
AGG (226)
AGC (222)
AAG (217)
AAC (149)
ACC (136)
AAT (122)
CCG (81)
ATC (34)
ACT (8)
ACG (1)
AGC (201)
AGG (97)
CCG (96)
AAC (49)
AAT (30)
AAG (19)
ACC (17)
ACG (15)
ACT (4)
ATC (4)
AAT (350)
AGG (182)
AGC (166)
CCG (98)
ATC (93)
AAC (66)
ACC (54)
AAG (36)
ACT (21)
ACG (3)
AGC (387)
AAC (189)
AAT (100)
ATC (86)
ACC (58)
AGG (58)
ACG (26)
CCG (19)
AAG (17)
ACT (16)
AAG (105)
AAT (70)
ATC (48)
ACC (28)
AGC (23)
AAC (19)
AGG (15)
ACG (12)
ACT (11)
CCG (6)
AAG (332)
AAC (139)
ATC (119)
AAT (108)
AGG (52)
ACC (42)
AGC (38)
CCG (24)
ACT (15)
ACG (11)
AAT (176)
AAC (125)
AAG (119)
ATC (82)
AGC (80)
ACG (28)
ACT (17)
AGG (13)
ACC (6)
AAT (119)
AAC (108)
AAG (59)
AGC (55)
ACC (36)
ATC (32)
AGG (31)
CCG (18)
ACT (15)
ACG (12)
4 AAAT (378)
AAAG (225)
AAAC (216)
AAGG (154)
AGAT (94)
ATCC (81)
AATG (56)
AGGG (52)
ACAT (26)
ACAG (15)
AATT (14)
AATC (12)
AACC (7)
AGGC (7)
ACCC (6)
AAGC (5)
ACCT (4)
ACTC (4)
ACGC (2)
AGCC (2)
CCCG (2)
AACT (1)
AAGT (1)
ACGG (1)
ACTG (1)
AGCT (1)
ATGC (1)
AAAT (537)
AAAC (270)
ATCC (263)
AAAG (260)
AAGG (164)
AATG (81)
AGGG (80)
AGAT (73)
AGCC (34)
ACAT (26)
ACAG (25)
AATC (19)
AATT (17)
ACCC (13)
AACC (9)
ACCT (8)
AGGC (8)
AAGC (5)
ACTC (4)
CCCG (4)
AGCT (3)
ACGC (2)
AACT (1)
ACGG (1)
ACGT (1)
ATGC (1)
AGAT (620)
AAAG (397)
AAAC (370)
AAGG (346)
AAAT (326)
ACAG (180)
AGGG (154)
ACAT (139)
AATG (64)
ATCC (63)
AGGC (57)
AACC (43)
AATT (22)
ACCC (22)
ACGC (22)
AAGC (19)
AATC (18)
ACCT (13)
ACTC (11)
ACTG (10)
AGCC (9)
CCCG (9)
AAGT (8)
AACT (7)
ACGG (4)
AGCG (3)
ACGT (2)
AACG (1)
ACCG (1)
AGCT (1)
ATGC (1)
AAAG (208)
AAGG (206)
AAAT (197)
AAAC (48)
ACAG (43)
AGGG (40)
ATCC (33)
AGAT (24)
CCCG (23)
AGGC (14)
AATG (13)
ACCC (12)
AAGT (11)
ACAT (9)
ACTC (9)
AGCC (9)
AAGC (6)
AATT (6)
ACCT (4)
AGAT (372)
ACAG (167)
AAAT (125)
ACAT (84)
AGGG (83)
ATCC (76)
AAAG (70)
AAGG (50)
AATC (49)
AAAC (39)
AGGC (39)
AATG (33)
AATT (23)
ACTC (22)
ACGC (10)
AGCC (10)
AACC (8)
AGCG (6)
CCCG (6)
ACGG (4)
AACT (3)
ACAT (81)
AAAT (73)
AAAC (34)
ACTG (28)
AGCC (28)
AGAT (26)
ATCC (25)
ACAG (19)
AACC (18)
AATG (17)
ACCG (11)
ACGG (11)
AGGC (10)
AATC (9)
ACTC (9)
AAAG (7)
AACT (6)
AGCG (5)
AATT (4)
AAGG (3)
AAGT (3)
ACGC (3)
ACCC (2)
ACCT (2)
ATCG (2)
ACGT (1)
AGCT (1)
ATGC (1)
AAAT (59)
ACCT (20)
AGGC (15)
AAAC (10)
AAGT (9)
AATT (6)
AAAG (5)
AATG (3)
ACAT (3)
ATCC (3)
AACC (2)
AATC (2)
AACG (1)
AAGG (1)
ACAG (1)
ACGG (1)
ACTC (1)
ACTG (1)
AGCC (1)
AAAT (51)
AAAG (31)
AAAC (20)
AATT (15)
ACAT (15)
AGAT (9)
AATC (6)
AATG (5)
ATGC (5)
AACC (3)
AACT (3)
AAGC (3)
ACGT (3)
ACTC (3)
AGCT (2)
ATCC (2)
AAGG (1)
ACAG (1)
ACGC (1)
ACTG (1)
AGCC (1)
AGGC (1)
AGGG (1)
ATCG (1)
AAAT (38)
ACAT (17)
AAAG (11)
AAAC (8)
AATG (5)
AATC (3)
AATT (3)
AGAT (3)
AAGG (2)
ACGT (2)
AAGT (1)
AAAT (56)
AAAG (26)
AAAC (16)
AATC (10)
AATT (9)
ACAT (9)
AATG (7)
ACCT (7)
ATCC (7)
ACCC (5)
AACC (4)
AAGT (4)
ACAG (4)
ACGG (4)
ACTC (4)
AGAT (4)
AGGC (4)
AAGG (3)
ACGC (3)
ACTG (2)
AGGG (2)
AACT (1)
AGCC (1)
AGCG (1)
CCCG (1)
5 AAAAC (285)
AAAAT (195)
AAAAG (133)
AGGGG (31)
AAGGG (20)
AAAGG (19)
AGCCC (19)
AAATT (16)
AAATG (15)
CCCCG (15)
ACCCC (14)
AGAGG (14)
AATAT (13)
AAGAG (12)
AAACC (9)
AGGGC (9)
AATAG (6)
AGCTC (6)
AATTC (4)
AACAG (3)
AACAT (3)
AATAC (3)
AATGG (3)
ACAGC (3)
ACTCC (3)
ATCCC (3)
CCCGG (3)
AAACT (2)
AAAGC (2)
AAATC (2)
AACAC (2)
ACACC (2)
ACAGG (2)
AGAGC (2)
AGATG (2)
AGGCC (2)
CCGCG (2)
AAAGT (1)
AACTG (1)
AAGAC (1)
AAGAT (1)
AAGGC (1)
AAGTG (1)
AATCT (1)
AATGC (1)
AATGT (1)
ACAGT (1)
ACATC (1)
ACCAG (1)
ACCTC (1)
ACGGG (1)
ACTAT (1)
ACTGC (1)
AGGAT (1)
ATATC (1)
ATGCC (1)
AAAAC (339)
AAAAT (257)
AAAAG (183)
AGGGG (40)
AATAT (35)
ACCCC (20)
AAATT (19)
AGAGG (19)
CCCCG (19)
AAGAG (18)
AAAGG (17)
AAACC (16)
AAGGG (14)
AGCCC (14)
AGGGC (11)
AACAT (9)
AGATG (7)
AGGCC (7)
AAATG (6)
AACAC (6)
AATAG (6)
AATAC (5)
ACAGG (5)
AGAGC (5)
ATCCC (5)
AAACT (4)
AATGG (4)
ACAGC (4)
AACAG (3)
AATTC (3)
ACACC (3)
AACTG (2)
AAGCC (2)
AATGC (2)
ACATC (2)
ACGCC (2)
ACTAT (2)
ACTGC (2)
AGCTC (2)
CCCGG (2)
AAACG (1)
AAAGC (1)
AAATC (1)
AAGAC (1)
AAGGC (1)
AAGTG (1)
ACAGT (1)
ACCCT (1)
ACCTG (1)
ACTCC (1)
AGGAT (1)
AGGCG (1)
ATGCC (1)
AAAAC (432)
AGCTC (133)
AAAAG (120)
AAAAT (91)
AGAGG (67)
AAGAG (62)
AAACC (57)
AGGGG (51)
AAAGG (47)
AGCCC (40)
ACCCC (37)
AAGGG (33)
CCCCG (23)
AAAGC (16)
AACCC (13)
ACAGG (12)
AGAGC (12)
AGGGC (10)
AATAT (9)
ACACC (9)
AACTG (8)
ACAGC (7)
ATCCC (7)
AACAC (6)
AGGCC (6)
CCCGG (6)
AAGAC (5)
AAGGC (5)
AATAG (5)
ATATC (5)
AACAG (4)
AATGT (4)
ACCTG (4)
ACGAG (4)
ACTCC (4)
AAACT (3)
AAATG (3)
AAGTG (3)
ACACT (3)
ACCAG (3)
ACCTC (3)
AGCAT (3)
AGCGG (3)
CCGCG (3)
AAATT (2)
ACAGT (2)
ACATG (2)
ACGCC (2)
AGGCG (2)
AAACG (1)
AAAGT (1)
AAATC (1)
AACCG (1)
AACGG (1)
AAGAT (1)
AAGCC (1)
AATCC (1)
AATCT (1)
AATGG (1)
AATTC (1)
ACACG (1)
ACATC (1)
ACCAT (1)
ACCCG (1)
ACCCT (1)
ACTAG (1)
ACTAT (1)
ACTCT (1)
ACTGC (1)
ACTGG (1)
AGATC (1)
AGCCG (1)
AGCGC (1)
AGGAT (1)
ATGCC (1)
AACTG (147)
AGCTC (107)
AAAAT (96)
AAAAC (68)
AGCCC (61)
AGGGG (46)
AGAGG (29)
AAAAG (22)
AAGGG (22)
AAAGG (19)
CCCCG (18)
AAGTG (17)
AATAT (15)
AGATC (11)
AAACC (8)
AAAGT (4)
AAATT (4)
AACTC (4)
AAGAC (4)
AAGAT (4)
AATAG (4)
AATCT (4)
AATGC (4)
AATGG (4)
ACAGC (4)
ACAGT (4)
ACCCC (4)
ACTGG (4)
AGCCG (4)
AGCGG (4)
AGGCC (4)
AGGCG (4)
AGGGC (4)
ATATC (4)
ATCCC (4)
CCCGG (4)
CCGCG (4)
AAAAT (93)
AAAAC (71)
CCCCG (57)
AAGGG (47)
AGAGG (45)
AGCGG (31)
AAAAG (26)
CCCGG (26)
AATAT (25)
AGGGG (22)
AAAGG (21)
AATTC (15)
CCGCG (15)
AAATC (14)
AATAG (13)
AGCTC (11)
AATCT (9)
AGCCT (9)
AACAG (8)
AGGGC (8)
AATCC (7)
ACAGG (6)
ACCGC (6)
AAAGT (5)
AAGCT (5)
ACACT (5)
ACATC (5)
ACATG (5)
ACGGG (5)
ACTAT (5)
ACTGC (5)
AGCAT (5)
AGCCG (5)
AACCG (4)
AACTC (4)
AAGAT (4)
ACCTC (4)
AGATG (4)
AAACT (3)
AAAGC (3)
AAATT (3)
AACAC (3)
AACGC (3)
AACGG (3)
AACTT (3)
AAGGT (3)
AATGT (3)
ACAGC (3)
ACCAG (3)
ACGCC (3)
ACTCG (3)
AGAGC (3)
AGATC (3)
AGCCC (3)
AGCGC (3)
ATATC (3)
AAAAT (48)
AAAAC (36)
AATAT (32)
AAATT (27)
AATCG (24)
AACTG (23)
AAACC (22)
AAATG (22)
AAACG (19)
ACTCC (19)
AACAG (17)
AATCC (16)
ATCCC (15)
ATCCG (15)
AAAGT (14)
AAAAG (13)
AAATC (13)
ACCAT (13)
ATCGC (13)
AAACT (12)
AACCG (11)
AATGG (11)
ACACC (11)
AATTC (10)
ACTAT (10)
AAAGG (9)
AGCTC (9)
AACCT (8)
AATAC (8)
ACTCG (8)
AACCC (7)
AACTC (7)
ACAGC (7)
ACCAG (7)
ACTGG (7)
AACTT (6)
AAGAG (6)
AAGCC (6)
AAGTC (6)
AATGT (6)
AGAGC (6)
AAAGC (5)
AACGG (5)
ACAGG (5)
AGGCC (5)
ATATC (5)
AACAC (4)
AAGAT (4)
AAGTG (4)
AATAG (4)
AATCT (4)
ACCCC (4)
ACGAT (4)
ACTGC (4)
AGCCC (4)
AGGGG (4)
AACAT (3)
AACGC (3)
AACGT (3)
AAGCT (3)
AATGC (3)
ACATC (3)
ACCGC (3)
ACCTC (3)
ACGGG (3)
AGAGG (3)
AGATG (3)
AGCCG (3)
AGGCG (3)
AGGGC (3)
CCCCG (3)
AAGAC (2)
AAGGC (2)
AAGGG (2)
AAGGT (2)
ACACG (2)
ACACT (2)
ACCGG (2)
ACCTG (2)
ACGAG (2)
ACGCG (2)
ACTCT (2)
AGATC (2)
AGCAT (2)
AGCCT (2)
AGCGC (2)
AAGCG (1)
ACAGT (1)
ACATG (1)
ACCCG (1)
ACCCT (1)
ACGCC (1)
ACGGC (1)
ACGTC (1)
ACTAG (1)
AGCGG (1)
AGGAT (1)
ATGCC (1)
CCGCG (1)
AAAAT (58)
AAATT (42)
AAAAC (19)
AAAAG (15)
AAATG (11)
AATTC (10)
AATAC (9)
AAATC (8)
AATAT (4)
AAACG (2)
AAACT (2)
AAAGT (2)
AACAC (2)
AAGAG (2)
AAGGG (2)
AATAG (2)
AATCG (2)
AATGT (2)
ACCCT (2)
AAACC (1)
AAAGG (1)
AACAG (1)
AACAT (1)
AACCC (1)
AACCT (1)
AACTC (1)
AACTG (1)
AACTT (1)
AAGAT (1)
AAGCC (1)
AAGTC (1)
AAGTG (1)
AATCC (1)
AATGG (1)
ACAGT (1)
ACATG (1)
ACCGT (1)
ACGCG (1)
ACTAG (1)
ACTCG (1)
ACTCT (1)
AGATC (1)
AGATG (1)
AGCCT (1)
AGCTC (1)
AGGGG (1)
ATATC (1)
ATCCC (1)
AAAAT (133)
AAAAC (60)
AAAAG (50)
AAATT (25)
AAACC (18)
AAGAG (18)
AATAT (15)
AAATC (12)
AACAC (9)
AAATG (7)
AACCG (7)
AATCC (7)
AAAGC (6)
AACTC (6)
ACCCG (6)
AGAGG (6)
AAACT (4)
AACAG (4)
AAGAT (4)
AATGT (4)
AATTC (4)
AGATC (4)
AACAT (3)
AACCC (3)
AATCG (3)
AATCT (3)
AGAGC (3)
AGATG (3)
AGGGG (3)
ATATC (3)
AAACG (2)
AAAGT (2)
AACTT (2)
AAGAC (2)
AATGC (2)
AATGG (2)
ACAGT (2)
ACCTC (2)
ACGCC (2)
AGCTC (2)
ATGCC (2)
CCCCG (2)
AAAGG (1)
AACCT (1)
AACGT (1)
AACTG (1)
AAGCC (1)
AAGCT (1)
AAGGG (1)
AAGTC (1)
AAGTG (1)
AATAC (1)
AATAG (1)
ACACC (1)
ACACT (1)
ACAGC (1)
ACATC (1)
ACATG (1)
ACCAG (1)
ACCAT (1)
ACCCC (1)
ACCGG (1)
ACCTG (1)
ACGAT (1)
ACGGC (1)
ACTAG (1)
ACTAT (1)
ACTCG (1)
ACTCT (1)
ACTGC (1)
ACTGG (1)
AGGCG (1)
ATCCG (1)
ATCGC (1)
CCCGG (1)
CCGCG (1)
AAAAG (53)
AGATG (32)
AAAAC (18)
AATAT (18)
AAAAT (9)
AAACG (6)
AACAC (6)
AATAG (5)
AAATC (4)
AAATG (4)
ACACC (4)
AAATT (3)
AATGG (3)
ACATC (3)
ACGAT (3)
ACTCC (3)
AAACT (2)
AAAGG (2)
AAGAG (2)
AAGAT (2)
AATAC (2)
AATTC (2)
ACTAT (2)
AGAGG (2)
AGCGG (2)
AGGCC (2)
ATCGC (2)
AAAGC (1)
AAGAC (1)
AAGCC (1)
AAGGG (1)
ACGCG (1)
ACTGC (1)
AGCCG (1)
AGCTC (1)
AAAAT (90)
AAAAG (40)
AAAAC (24)
AAATT (23)
AATAT (10)
ACTAT (10)
AAACC (8)
AAAGG (8)
AAGAG (8)
AATTC (7)
AAAGC (6)
AAATC (6)
AAATG (6)
AATAC (6)
AGGGG (6)
AATAG (5)
ACTGG (5)
AAACT (4)
AACAC (4)
AAGGC (4)
AATGT (4)
ACTGC (4)
ATATC (4)
ATGCC (4)
AACAG (3)
AACCC (3)
AACCT (3)
AAGAC (3)
AAGAT (3)
AATGC (3)
ACAGC (3)
ACGCC (3)
ACTCT (3)
AGAGC (3)
AGATG (3)
AGCCC (3)
AGCTC (3)
AGGGC (3)
ATCCC (3)
AAACG (2)
AAAGT (2)
AACCG (2)
AAGCC (2)
AAGGG (2)
AATCC (2)
AATCG (2)
AATGG (2)
ACACC (2)
ACACT (2)
ACCAT (2)
ACCCT (2)
ACGAG (2)
ACGAT (2)
ACTCG (2)
AGAGG (2)
AGCAT (2)
AGGAT (2)
AACGC (1)
AACTC (1)
AACTG (1)
AACTT (1)
AAGCG (1)
AAGCT (1)
AAGTC (1)
ACATC (1)
ACCCC (1)
ACCGC (1)
ACGCG (1)
ACGTC (1)
ACTAG (1)
ACTCC (1)
AGATC (1)
AGCCT (1)
AGGCG (1)
ATCGC (1)
6 AAAAAC (99)
AAAAAT (66)
AAAAAG (38)
AGAGGG (14)
AGATAT (11)
ACCCCC (8)
AAGGAG (7)
AAGGGG (5)
ACAGAG (5)
ACATAT (5)
CCCCCG (5)
AAAATT (4)
AACCCT (4)
AGCCCC (4)
AGGGGG (4)
CCCCGG (4)
AAAACC (3)
AAAGAG (3)
AAATAT (3)
AAGAGG (3)
ACACAT (3)
AAAGGG (2)
AAATTT (2)
ACCATC (2)
ACCCTG (2)
AGGCCC (2)
AGGGCC (2)
AGGGGC (2)
AAAAGG (1)
AAAATC (1)
AAAATG (1)
AAACAG (1)
AAATAC (1)
AACATC (1)
AACCCC (1)
AAGGGC (1)
AATAGT (1)
AATATT (1)
AATCAT (1)
ACACAG (1)
ACACCC (1)
ACACGC (1)
ACAGGG (1)
ACCCTC (1)
ACCGCC (1)
ACCTCC (1)
ACTGCC (1)
AGAGAT (1)
AGAGGC (1)
AGATGG (1)
AGCCGG (1)
AGCCTC (1)
AGCGCC (1)
AGCTCC (1)
AGGGCG (1)
ATCCCC (1)
CCCGCG (1)
AAAAAC (123)
AAAAAT (86)
AAAAAG (52)
AGAGGG (23)
ACCATC (11)
ACCCCC (10)
AGCCCC (9)
AGATAT (8)
AGGGGG (8)
AAAGAG (6)
AAGAGG (6)
AAGGAG (6)
AACCCT (5)
ACACAT (5)
ACCTCC (5)
AGGGCC (5)
AGGGGC (5)
AAAACC (4)
ACAGAG (4)
AAAAGG (3)
AAAATT (3)
AAATAC (3)
AAATAT (3)
AAGGGG (3)
ACAGGG (3)
ACATAT (3)
AGAGGC (3)
AGCCGG (3)
AGGCCC (3)
AGGCGG (3)
CCCCCG (3)
AAAGGG (2)
AAGGGC (2)
ACAGCC (2)
ACCAGC (2)
ACCCTG (2)
CCCCGG (2)
AAAAGC (1)
AAAATC (1)
AAAATG (1)
AAACAG (1)
AAACTC (1)
AAAGGC (1)
AAATAG (1)
AAATCC (1)
AAATGG (1)
AAATTG (1)
AACAGC (1)
AACATC (1)
AACCCC (1)
AACTCC (1)
AAGATG (1)
AAGCAG (1)
AAGCCC (1)
AAGGCC (1)
AAGGCG (1)
AAGTGT (1)
AATAGT (1)
AATATG (1)
AATATT (1)
AATCAT (1)
AATCCT (1)
AATGAT (1)
AATGCT (1)
AATGTG (1)
AATTAT (1)
AATTCC (1)
ACACAG (1)
ACACCC (1)
ACACGC (1)
ACACTC (1)
ACAGAT (1)
ACAGGC (1)
ACCATG (1)
ACCCAG (1)
ACCCCG (1)
ACCCGG (1)
ACCCTC (1)
ACCGCC (1)
ACCGCT (1)
ACCTGC (1)
ACGATG (1)
ACGCGC (1)
ACTATC (1)
ACTCCC (1)
ACTGCC (1)
ACTGGG (1)
AGAGCC (1)
AGATGG (1)
AGCAGG (1)
AGCATG (1)
AGCCTC (1)
AGCCTG (1)
AGCTCC (1)
AGGCCG (1)
AGGGCG (1)
ATGCCC (1)
CCCGCG (1)
ACAGGC (171)
AGAGGC (146)
AAAAAC (96)
ACAGAG (71)
AGAGGG (59)
ACCCCC (36)
ACACAG (34)
AAGGAG (31)
AAAAAG (30)
AGCCCC (22)
ACATAT (20)
AGATAT (18)
AAAACC (17)
AGGGGC (16)
AAGAGG (14)
AGCCTC (14)
AGCAGG (13)
AGGGGG (13)
ACACAT (12)
AAAAAT (9)
ACACCC (8)
AGAGAT (8)
AGCCCT (8)
AGCCTG (8)
AAAGGG (7)
AACCCT (7)
ACACGC (7)
AAAGAG (6)
AAATAT (6)
AGCTCC (5)
AGGCGG (5)
ACAGTG (4)
ACCATG (4)
AGGGAT (4)
CCCCGG (4)
AAGCAG (3)
AAGGGG (3)
AATGAT (3)
ACCAGC (3)
ACGCGC (3)
AGAGCC (3)
AGATCG (3)
AGCGGC (3)
AGGCCC (3)
AGGGCC (3)
CCCCCG (3)
AACTTG (2)
AAGGCT (2)
AATATT (2)
AATGAG (2)
ACATGC (2)
ACCATC (2)
ACCGCC (2)
ACGCAG (2)
ACTCCC (2)
ACTGCC (2)
AGCATC (2)
AGCCGG (2)
AGCGGG (2)
AGCTGC (2)
ATGCCC (2)
AAAATC (1)
AAACAC (1)
AACAGC (1)
AACCAG (1)
AACCTG (1)
AACGCC (1)
AAGATG (1)
AAGGCC (1)
AAGTCT (1)
AATTCG (1)
ACACTC (1)
ACAGAT (1)
ACAGCC (1)
ACAGGG (1)
ACAGGT (1)
ACATGT (1)
ACCCAG (1)
ACCCCG (1)
ACCCGC (1)
ACCCTC (1)
ACCGCG (1)
ACCTCC (1)
ACCTCT (1)
ACGAGC (1)
ACGAGG (1)
ACGGCC (1)
ACGGGC (1)
ACTCTG (1)
ACTGCG (1)
ACTGGG (1)
AGAGCG (1)
AGAGCT (1)
AGATCC (1)
AGCCCG (1)
AGGCCT (1)
AGGCGC (1)
ATGGCC (1)
CCCGCG (1)
AGAGCG (151)
ACACGC (95)
AAAAAC (53)
ACAGCC (50)
ACAGAG (33)
ACCCCC (30)
AAGGCC (25)
AGAGGC (17)
CCCCCG (17)
AAAAAG (15)
AAAGTG (15)
AACCTC (15)
AATAGG (15)
AGGGGC (15)
ACACAG (12)
AGCCGC (10)
CCCCGG (10)
ACACCC (8)
AGGGGG (7)
AAATAT (5)
AACAAG (5)
AACCCT (5)
AAGCCC (5)
AATGAG (5)
ACACGT (5)
ACAGTG (5)
ACCACT (5)
ACCAGG (5)
ACCCCG (5)
ACCCGG (5)
ACCTCC (5)
ACTGAG (5)
ACTGCT (5)
AGAGCC (5)
AGAGGG (5)
AGCCAT (5)
AGGATC (5)
AGGGCC (5)
CCCGCG (5)
AACCCT (30)
AAAAAG (20)
AATCCC (20)
AATAGT (13)
AGCTCC (12)
AAAAAC (10)
AAAAAT (10)
ACACGC (10)
AATCTG (9)
ACTGCT (7)
CCCCGG (7)
AACGGG (4)
AAGATT (4)
AAGGAG (4)
AAAACT (3)
AAAAGG (3)
AAAATT (3)
AAAGAC (3)
AAATGT (3)
AACCTG (3)
AAGAAT (3)
AATCAC (3)
AATCAG (3)
ACAGAG (3)
ACAGCG (3)
ACAGCT (3)
ACAGGG (3)
ACATAT (3)
ACCCCC (3)
ACCCTC (3)
ACCCTG (3)
ACGGGC (3)
AGAGCC (3)
AGCCGC (3)
ACAGAT (52)
AACAGC (32)
AGCAGG (19)
ACATCC (18)
AACTGC (16)
AATGGG (15)
AAATAT (14)
AATCCC (14)
AGCTCC (14)
AAAAAT (12)
AATCCG (11)
AAAAAC (10)
AAACAG (10)
AATACT (10)
ATCGCC (10)
AAAACC (9)
AATGCG (9)
ATGCCC (9)
AACAAT (8)
AATCTG (8)
ACATAT (8)
AGGATG (8)
AAATGC (7)
AACTCC (7)
AAGTGG (7)
AATCAG (7)
ACTGAT (7)
ACTGCC (7)
AGATGG (7)
AAACAT (6)
AAACTG (6)
AAATGG (6)
AAGGAC (6)
AATGGC (6)
AATGGT (6)
ACCAGC (6)
ACCCAT (6)
AGCATC (6)
AGCGGC (6)
ATCCCC (6)
ATCCGC (6)
AAAATG (5)
AAACCC (5)
AAAGCC (5)
AAAGGC (5)
AAATCC (5)
AAATTC (5)
AACGGG (5)
AACTGG (5)
AAGACC (5)
AAGATG (5)
AATACG (5)
AATATG (5)
AATCGG (5)
AATGCC (5)
AATTAC (5)
ACACTC (5)
ACATGG (5)
ACCATC (5)
ACGAGG (5)
ACGCCC (5)
AGATGC (5)
AGGGGC (5)
AAACCG (4)
AAATAC (4)
AAATTT (4)
AACAGT (4)
AACGGC (4)
AACTAC (4)
AACTGT (4)
AATCGC (4)
AATGTG (4)
ACATCG (4)
ACCCAG (4)
ACGATG (4)
ACTCGC (4)
AGAGCC (4)
ATCCCG (4)
ATCGGC (4)
AAAAAG (3)
AAAACG (3)
AAAAGC (3)
AAAATC (3)
AAAATT (3)
AAACAC (3)
AAATTG (3)
AACAAG (3)
AACAGG (3)
AACATC (3)
AACCAG (3)
AACTCG (3)
AAGATC (3)
AAGCCC (3)
AAGCTG (3)
AAGTCC (3)
AATACC (3)
AATCAT (3)
AATCTC (3)
AATTCC (3)
ACACGC (3)
ACAGCC (3)
ACAGCT (3)
ACAGGC (3)
ACAGTC (3)
ACCGCC (3)
ACCTGG (3)
ACGGAT (3)
ACTGCG (3)
ACTGGC (3)
ACTGGG (3)
AGATAT (3)
AGGATC (3)
AAAACT (2)
AAACGG (2)
AAAGAC (2)
AAATCG (2)
AACGAC (2)
AACGAT (2)
AACTAT (2)
AACTCT (2)
AAGAAT (2)
AAGGAG (2)
AAGTGC (2)
AATAGG (2)
AATAGT (2)
AATATC (2)
AATTGC (2)
ACACAT (2)
ACACGG (2)
ACAGAG (2)
ACAGGG (2)
ACCAGT (2)
ACGGCG (2)
ACGTAG (2)
ACGTCC (2)
ACTCCC (2)
ACTGAG (2)
AGAGGC (2)
AGATCG (2)
AGCCCC (2)
AGCCGC (2)
AGCTGC (2)
ATATCC (2)
AAAAGG (1)
AAAAGT (1)
AAACTC (1)
AAAGAG (1)
AAAGAT (1)
AAAGCT (1)
AAAGGG (1)
AAAGTC (1)
AAAGTG (1)
AAAGTT (1)
AAATAG (1)
AAATCT (1)
AAATGT (1)
AACACC (1)
AACACG (1)
AACATG (1)
AACATT (1)
AACCAC (1)
AACCAT (1)
AACCCC (1)
AACCCG (1)
AACCGC (1)
AACCGG (1)
AACCGT (1)
AACCTT (1)
AACGCC (1)
AACGGT (1)
AACGTC (1)
AACTTC (1)
AACTTG (1)
AAGACG (1)
AAGCAC (1)
AAGCAG (1)
AAGCGG (1)
AAGGCG (1)
AAGGGG (1)
AAGGTG (1)
AAGTAG (1)
AAGTAT (1)
AAGTCG (1)
AAGTGT (1)
AATAGC (1)
AATATT (1)
AATCAC (1)
AATCGT (1)
AATGAC (1)
AATGAG (1)
AATGAT (1)
AATGCT (1)
AATTAG (1)
AATTAT (1)
ACACAG (1)
ACACCC (1)
ACACCT (1)
ACACGT (1)
ACAGCG (1)
ACAGTG (1)
ACATCT (1)
ACATGC (1)
ACCACG (1)
ACCACT (1)
ACCAGG (1)
ACCATG (1)
ACCCCC (1)
ACCCGC (1)
ACCCTC (1)
ACCGAT (1)
ACCGGC (1)
ACCGGT (1)
ACCGTC (1)
ACCTAT (1)
ACCTCC (1)
ACCTGC (1)
ACGAGT (1)
ACGCAT (1)
ACGCTG (1)
ACGGAG (1)
ACGGCC (1)
ACGGGC (1)
ACGGGG (1)
ACGTCG (1)
ACTAGG (1)
ACTATC (1)
ACTATG (1)
ACTCAG (1)
ACTCAT (1)
ACTCCG (1)
ACTCGG (1)
AGAGGG (1)
AGATCC (1)
AGCATG (1)
AGCCAT (1)
AGCCGG (1)
AGCCTC (1)
AGCTAT (1)
AGGCAT (1)
AGGCCC (1)
AGGCCG (1)
AGGCGG (1)
AGGGAT (1)
AGGGGG (1)
ATCATG (1)
CCCGCG (1)
AAGCCT (252)
AAAAAT (21)
AGCCTG (20)
AGGCAT (20)
AAAATT (10)
ACCTAG (10)
ACCTAT (9)
AAAACG (8)
ACATAT (7)
AAATTT (6)
AAAAAG (5)
AAATTC (5)
AAATTG (5)
AAAGCC (4)
AAGTCT (4)
AAAATG (3)
AAACCT (3)
ACCAGG (3)
ACCTCC (3)
AGCTCC (3)
AAAAAC (2)
AAAACC (2)
AAATAT (2)
AAGATG (2)
AAGCAT (2)
AATCAT (2)
AAAACT (1)
AAAAGG (1)
AAAATC (1)
AAACAC (1)
AAACAG (1)
AAACTG (1)
AAAGAG (1)
AAAGGT (1)
AAAGTT (1)
AAATAC (1)
AAATGG (1)
AACACC (1)
AACAGC (1)
AACCCT (1)
AACTAC (1)
AACTAG (1)
AACTGG (1)
AAGAGG (1)
AAGCCC (1)
AAGCCG (1)
AAGGAG (1)
AAGGAT (1)
AAGTGG (1)
AATAGT (1)
AATCAG (1)
AATCTG (1)
AATTAT (1)
ACACAT (1)
ACACCT (1)
ACATCC (1)
ACATCT (1)
ACCATC (1)
ACCCCG (1)
AGAGAT (1)
AGAGCC (1)
AGGATG (1)
AAAAAT (34)
AAAAAC (19)
AAAAAG (14)
AAGATG (8)
AAAACC (6)
AAAGAG (6)
AAGGAG (6)
AACCCG (5)
AAGAGG (5)
AAAATC (4)
AAAATT (4)
AAACAC (4)
AAACGG (4)
ACCATC (4)
ACCTCC (4)
AAAGCC (3)
AACAAG (3)
AACAGC (3)
AAGAAT (3)
ACCCCC (3)
AGAGGC (3)
AGCCTG (3)
AAAACT (2)
AAAGGC (2)
AAATAT (2)
AAATGC (2)
AACAAT (2)
AACACC (2)
AACCAC (2)
AAGCAG (2)
AAGTGG (2)
AATATG (2)
AATCAC (2)
AATCAG (2)
AATGAT (2)
ACATAT (2)
ACCAGC (2)
ACCGCC (2)
ACGAGG (2)
ACGGCG (2)
ACTGAG (2)
AGAGGG (2)
AGGCGG (2)
ATCATG (2)
ATCCGG (2)
CCGGCG (2)
AAAAGC (1)
AAAAGG (1)
AAAATG (1)
AAACAG (1)
AAACCG (1)
AAACCT (1)
AAACGC (1)
AAACTG (1)
AAACTT (1)
AAAGAC (1)
AAAGGG (1)
AAAGTG (1)
AAAGTT (1)
AAATAC (1)
AAATAG (1)
AAATCG (1)
AAATGG (1)
AAATTC (1)
AAATTG (1)
AAATTT (1)
AACATC (1)
AACATG (1)
AACCCT (1)
AACCTG (1)
AACGGT (1)
AACTCC (1)
AACTGT (1)
AACTTG (1)
AAGACC (1)
AAGACG (1)
AAGATC (1)
AAGCAC (1)
AAGTAC (1)
AATACC (1)
AATACT (1)
AATATC (1)
AATATT (1)
AATCCC (1)
AATCGC (1)
AATCTC (1)
AATCTG (1)
AATGAG (1)
AATGGC (1)
AATGGG (1)
AATGGT (1)
AATTAT (1)
ACAGAG (1)
ACAGAT (1)
ACAGTG (1)
ACCACG (1)
ACCACT (1)
ACCAGT (1)
ACCGGC (1)
ACGCCG (1)
ACGGAG (1)
ACGTAT (1)
ACGTCC (1)
ACTCTC (1)
AGAGAT (1)
AGAGCT (1)
AGATAT (1)
AGATGG (1)
AGCCAT (1)
AGCCCC (1)
AGCCCG (1)
AGCCGC (1)
AGCCGG (1)
AGCCTC (1)
AGCGGC (1)
AGCGGG (1)
AGCTCC (1)
AGCTGC (1)
AGGATC (1)
AGGATG (1)
AGGGGC (1)
CCCGCG (1)
ACACCC (50)
AACAGC (49)
AAAAAG (22)
AAAAAC (21)
AAGATG (17)
AAGAGG (13)
AAAAAT (12)
AAAATG (9)
AACAAG (9)
AAGACG (9)
AATCAT (9)
ACGATG (9)
AAGCAC (8)
AAAATC (6)
AAGCTG (6)
AGGATG (6)
AAAGTG (5)
AACAAT (5)
AACATG (5)
ACAGGC (5)
ACATAT (5)
ACTATC (5)
AGCATC (5)
AAAATT (4)
AAACCG (4)
AACGAC (4)
AAGCGG (4)
AAGCTC (4)
AAGTAG (4)
AATATG (4)
AGCCTG (4)
AAGGTC (3)
ACAGCG (3)
AGAGGC (3)
AAAAGG (2)
AAATAC (2)
AAATGC (2)
AACACT (2)
AACCAC (2)
AACGAT (2)
AACTCG (2)
AACTGC (2)
AAGCAG (2)
AATAGT (2)
AATATC (2)
AATCAG (2)
AATGAC (2)
AATTAG (2)
AATTAT (2)
ACACAG (2)
ACACGC (2)
ACAGAG (2)
ACTCCG (2)
AGAGCC (2)
AGCGCC (2)
AGCTGC (2)
AAAACG (1)
AAACAC (1)
AAACAG (1)
AAAGGC (1)
AACAGG (1)
AACCGC (1)
AACCTG (1)
AAGAGC (1)
AAGCCC (1)
AAGGAG (1)
AAGGGC (1)
AAGTCG (1)
AATAGC (1)
AATCTG (1)
AATGAT (1)
ACACTC (1)
ACAGTC (1)
ACCAGC (1)
ACCATC (1)
ACCGCC (1)
ACCTGC (1)
ACGAGG (1)
ACGCCC (1)
ACTCAG (1)
ACTGCG (1)
AGAGAT (1)
AGCCGC (1)
AGCGAT (1)
AGGCGC (1)
ATATCC (1)
ATCCCG (1)
AAAAAT (65)
AACCCT (62)
AAAAAG (16)
AAAGAG (13)
AACCAG (13)
AACAGC (11)
AAGATG (10)
AAAAAC (9)
AAGAGG (7)
AATGAT (7)
ACCAGT (7)
AAAATT (6)
AAATAG (5)
AGCCTG (5)
AAAAGG (4)
AACCAC (4)
ACCCCC (4)
AGGGGG (4)
AAAAGC (3)
AAAATG (3)
AAATAT (3)
AAATCC (3)
AAATTT (3)
AACACC (3)
AACCGC (3)
AAGCTG (3)
AAGGAG (3)
AAGTAT (3)
AATGTG (3)
ACCAGC (3)
ACCCGC (3)
ACCTGG (3)
ACTGCC (3)
AGAGAT (3)
AGAGCC (3)
AGCAGG (3)
AGGGCG (3)
AGGGGC (3)
AAAATC (2)
AAACAC (2)
AAACAG (2)
AAATTG (2)
AACATC (2)
AAGCAG (2)
AAGCTC (2)
AAGGGC (2)
AAGGTG (2)
AAGTGG (2)
AATATT (2)
ACAGGG (2)
ACATAT (2)
ACCCTG (2)
ACCTCC (2)
ACGGCG (2)
ACTGGC (2)
AGAGCG (2)
AGAGCT (2)
AGAGGG (2)
AGCTCC (2)
ATATGC (2)
AAAACC (1)
AAAACG (1)
AAAACT (1)
AAAAGT (1)
AAACAT (1)
AAACCC (1)
AAACTG (1)
AAAGAT (1)
AAAGCC (1)
AAAGGC (1)
AAAGTG (1)
AAATGC (1)
AAATGG (1)
AAATTC (1)
AACAAG (1)
AACACT (1)
AACATG (1)
AACATT (1)
AACCCG (1)
AACGGC (1)
AACGGG (1)
AACTCG (1)
AAGACG (1)
AAGCCC (1)
AAGGAC (1)
AAGGGT (1)
AAGTAC (1)
AATAGC (1)
AATATG (1)
AATCAC (1)
AATCAG (1)
AATCCT (1)
AATCTC (1)
AATGAC (1)
AATGCG (1)
AATGGG (1)
AATGTC (1)
AATTAC (1)
AATTAG (1)
AATTCC (1)
ACACCC (1)
ACACGC (1)
ACAGAG (1)
ACATGC (1)
ACCATC (1)
ACCCAG (1)
ACCCTC (1)
ACCGTC (1)
ACCGTG (1)
ACGCCG (1)
ACGGGC (1)
ACGTAG (1)
ACTAGT (1)
ACTCCT (1)
ACTCGC (1)
ACTCTC (1)
ACTGAG (1)
AGAGGC (1)
AGATAT (1)
AGATCG (1)
AGCATC (1)
AGCCCC (1)
AGCCCG (1)
AGCCGC (1)
AGCCGG (1)
AGCGGG (1)
AGCTGC (1)
ATCCGC (1)
CCCCGG (1)
CCGGCG (1)

© Tóth, Gáspári, and Jurka (2000)