Simple sequence repeats longer than 12 bp
 
Simple sequence repeats in exons
(Top 100 % listed in the order of total length)
(Normalized total lengths [bp / 1 Mbp of DNA sequence] are shown in parentheses after each repeated motif.)
Length of
repeated
motif
(bp)
Taxonomic group
Primates Rodentia Mammalia Vertebrata Arthropoda C. elegans Embryophyta S. 
cerevisiae
Fungi  
1 A (49)
A (62)
A (69)
A (30)
C (19)
A (12)
A (23)
C (20)
A (17)
C (1)
A (36)
A (9)
2 AG (6)
AC (4)
AC (29)
AG (24)
AT (17)
AG (69)
CG (19)
- AC (21)
AT (7)
AG (6)
AG (29)
AC (16)
AT (9)
AG (39)
AT (7)
AC (4)
AT (14)
AC (5)
AC (2)
AT (2)
3 CCG (394)
AGC (381)
AGG (192)
ACC (58)
AAG (57)
ATC (26)
AAC (8)
ACG (5)
ACT (5)
AGC (889)
CCG (290)
ACC (184)
AGG (143)
AAG (29)
ATC (22)
AGC (376)
AGG (219)
CCG (154)
ACG (65)
AAG (22)
ACC (22)
ATC (18)
AGC (337)
AGG (210)
CCG (157)
ACC (46)
AAG (43)
ACG (15)
ATC (15)
AGC (954)
AAC (220)
ACC (142)
AGG (83)
CCG (78)
ATC (58)
ACG (21)
AAT (10)
AAG (81)
ACC (65)
ATC (41)
AAC (33)
AGC (31)
AAT (19)
AGG (14)
ACG (10)
CCG (8)
ACT (6)
AAG (317)
AAC (253)
ATC (138)
AGC (108)
AGG (106)
ACC (89)
CCG (71)
ACG (20)
ACT (13)
AAT (4)
AAC (156)
AAG (147)
AAT (123)
AGC (112)
ATC (103)
ACG (27)
AGG (21)
ACC (12)
ACT (5)
AAC (107)
AGC (67)
AAG (55)
AAT (34)
AGG (27)
ACC (26)
CCG (26)
ATC (22)
ACG (12)
ACT (5)
4 AAAT (11)
AATC (8)
AAAC (5)
AATG (5)
AAGG (28)
AAAC (14)
CCCG (9)
AACC (6)
AGGC (6)
AAAC (19)
- - ATCC (5)
AAAG (2)
AAAT (2)
AATG (2)
ACAT (2)
AACC (1)
AACG (1)
AATC (1)
ACTG (1)
AGGC (1)
AAAT (1)
ATCG (1)
ACAT (3)
AAAG (2)
AATG (2)
AGGG (2)
5 AAAAC (11)
AAAGG (6)
AAAAG (5)
AAGAG (5)
AATGG (5)
ACCCC (5)
ACTCC (5)
AGCCC (5)
AGGGG (5)
CCCCG (5)
AAGAG (41)
AGAGG (19)
AAAAC (14)
CCCGG (12)
AAAGG (6)
AAGGC (6)
ACACC (6)
AGGCC (6)
CCGCG (6)
CCCGG (18)
ACGCC (13)
AGCGG (13)
AATCC (6)
AAAAC (5)
AGGCC (5)
CCCCG (5)
AAAAG (6)
AAAAT (6)
AAATC (3)
AAATG (2)
AAGAG (2)
AATTC (2)
ACATG (2)
AAAAC (1)
AACAC (1)
AACCC (1)
AAGCC (1)
AATAC (1)
AATCG (1)
AATGC (1)
AATGG (1)
ACCTC (1)
ACTCC (1)
ACTCG (1)
ACTCT (1)
AGCCC (1)
AGGGG (1)
ATGCC (1)
AAGAG (5)
ACCCG (5)
AAAAC (3)
AAAAG (3)
AGAGG (3)
AAACC (1)
AAAGC (1)
AACGC (1)
AAGTC (1)
AATCC (1)
AATGG (1)
ACACC (1)
ACTCT (1)
CCCGG (1)
CCGCG (1)
AAAAG (21)
AAAAC (6)
AAATC (4)
ATCGC (4)
ACGCG (3)
AAACG (2)
AAAGC (2)
AAGAC (2)
AAGAG (2)
AATTC (2)
AGATG (2)
AGGCC (2)
AAAAG (10)
AGCTC (3)
AAAAT (2)
AAAGG (2)
AAAGT (2)
AAATG (2)
AACAC (2)
AATAG (2)
AATGC (2)
AATGG (2)
ACCAT (2)
ACTGG (2)
ATATC (2)
6 CCCCGG (51)
AGCTCC (17)
AGGGCG (15)
ACGCCC (13)
AAGAGG (11)
ACCCGC (11)
AGGCCC (11)
AGGGGC (11)
CCCCCG (11)
AGCGCC (9)
AAAAAC (6)
AACATC (6)
AAGGAG (6)
ACAGCC (6)
ACCCCG (6)
ACCGCC (6)
ACGAGG (6)
AGAGCC (6)
AGCAGG (6)
AGCCGG (6)
AGCGGC (6)
AGGATG (6)
ATCCCG (6)
CCCGCG (6)
ACAGGC (346)
AGCCTG (58)
ACCAGC (19)
ACCATG (16)
AGAGCC (14)
AGGGGG (14)
AATGAG (9)
ACAGTG (9)
AGCTCC (9)
AAAAAG (7)
AACAGC (7)
AACGCC (7)
AAGAGG (7)
AAGGCC (7)
ACAGGG (7)
ACAGGT (7)
ACCCCC (7)
ACCCGC (7)
ACGAGC (7)
ACGGCC (7)
ACTCCC (7)
ACTGCG (7)
AGCGGC (7)
AGCTGC (7)
AGGCCC (7)
ATGCCC (7)
CCCGCG (7)
AAGGCC (108)
AGCCGC (43)
AGAGGC (29)
AAGCCC (22)
ACAGTG (22)
ACCACT (22)
ACCCCC (22)
AGCCAT (22)
AGGATC (22)
CCCCGG (22)
CCCGCG (22)
ACTGCT (30)
ACCCTC (15)
AGCCGC (15)
CCCCGG (15)
AACAGC (78)
AACTGG (34)
ACGCCC (23)
AGCGGC (23)
AAGCCC (21)
AAGGAC (17)
AAGGAG (17)
ACCTGG (17)
AGCAGG (17)
AGCTCC (17)
AAGATG (13)
AACACC (11)
AATGGC (11)
ACACGG (11)
ACAGCC (11)
AGCCGC (11)
AGCTGC (11)
ATCCGC (11)
ATGCCC (11)
AACTCC (8)
AATGCC (8)
AAATTC (6)
AAATTT (6)
AACAGG (6)
AACATC (6)
AACCAC (6)
AACCGC (6)
AACGAC (6)
AACGGT (6)
AACTCG (6)
AATCAC (6)
AATCAT (6)
AATCCC (6)
AATCCG (6)
AATGTG (6)
ACACCC (6)
ACAGCG (6)
ACAGGC (6)
ACAGGG (6)
ACAGTC (6)
ACAGTG (6)
ACATGG (6)
ACCAGC (6)
ACCCCC (6)
ACCGCC (6)
ACCGGC (6)
ACGATG (6)
ACGGCC (6)
ACGGCG (6)
ACGTCG (6)
ACTATC (6)
ACTGCG (6)
ACTGGC (6)
AGATCG (6)
AGCATC (6)
AGGCGG (6)
ACCAGG (11)
ACCTCC (8)
AGCTCC (8)
AAGCCT (7)
AACAGC (5)
AACTAC (4)
AAGATG (4)
AAAAAG (3)
AAATGG (3)
AAATTC (3)
AAGAGG (3)
AGGATG (3)
AAAAAT (2)
AAAACG (2)
AAAAGG (2)
AACACC (2)
AACTGG (2)
AAGCCC (2)
AAGGAG (2)
ACCATC (2)
AGCCGG (2)
AGCCTG (2)
AAAACC (1)
AAAATT (1)
AAACGG (1)
AAAGGC (1)
AACCTG (1)
AACGCC (1)
AACTCC (1)
AACTTG (1)
AAGAAT (1)
AAGCAG (1)
AAGCTG (1)
AAGTGG (1)
AATCTG (1)
AATGAC (1)
AATGAT (1)
AATTAT (1)
AATTCC (1)
ACACCT (1)
ACACGG (1)
ACAGAG (1)
ACAGGC (1)
ACATAT (1)
ACATCC (1)
ACATCT (1)
ACCAGC (1)
ACCGCC (1)
ACCGGC (1)
ACCTCT (1)
AGAGCC (1)
AGATCC (1)
AGATCG (1)
AGCATC (1)
AGCCCC (1)
AGGCGG (1)
AAGGAG (17)
AGCCTG (13)
ACCATC (11)
AACAGC (9)
AAGATG (9)
ACTGAG (9)
AAAGGC (8)
ACGGCG (8)
AACACC (7)
AAGAGG (7)
ACCGCC (7)
ACCTCC (7)
ACGCCG (7)
ACCGGC (6)
AGGCGG (6)
AAAACC (5)
ACAGTG (5)
AGCTCC (5)
CCGGCG (5)
AAAGCC (4)
AACCTG (4)
AAGTGG (4)
AGGATG (4)
AACAAG (3)
AACTCC (3)
AAGACG (3)
AATATG (3)
AGAGCT (3)
AGAGGC (3)
AGCGGC (3)
ATCATG (3)
AAAAAG (2)
AAAAAT (2)
AAAATC (2)
AAACGG (2)
AAACTG (2)
AAAGAG (2)
AAAGGG (2)
AAAGTG (2)
AAATGC (2)
AACAAT (2)
AACATC (2)
AACATG (2)
AACCAC (2)
AACCTC (2)
AACGGT (2)
AACTAC (2)
AAGAGC (2)
AAGCAG (2)
AAGCTG (2)
AAGGAC (2)
AAGGCC (2)
AAGGGC (2)
AAGGTC (2)
AAGGTG (2)
AAGTAC (2)
AATCTC (2)
AATGAG (2)
AATGGC (2)
AATGGG (2)
ACACAG (2)
ACAGGC (2)
ACATCG (2)
ACCACT (2)
ACCAGT (2)
ACCATG (2)
ACCCCC (2)
ACCGGT (2)
ACGAGG (2)
ACGATG (2)
ACGCAG (2)
ACGGCC (2)
ACTCAT (2)
ACTCCC (2)
ACTCTC (2)
AGAGGG (2)
AGCAGG (2)
AGCCCC (2)
AGCCGG (2)
AGCCTC (2)
AGCGGG (2)
AGCTGC (2)
AGGATC (2)
AGGCCG (2)
ATCCGG (2)
ATCGGC (2)
CCCGCG (2)
AACAGC (61)
AAGATG (19)
ACGATG (18)
AAGAGG (15)
AAAAAG (12)
AAAATC (12)
AAGACG (12)
AAGCTG (9)
AGCCTG (8)
AAACCG (7)
ACAGGC (7)
AGGATG (7)
AGAGGC (6)
AAAAAC (5)
AAAATG (5)
AAAGTG (5)
AACAAG (5)
AACAAT (5)
AACATG (5)
AACGAC (5)
AACGAT (5)
AACTGC (5)
AAGGTC (5)
AAGTAG (5)
ACTATC (5)
AGCGCC (5)
AGCTGC (5)
AATCAT (4)
AAAAGG (3)
AAATGC (3)
AACTCG (3)
AAGCAC (3)
ACAGCG (3)
AAAACG (2)
AAACAC (2)
AAAGGC (2)
AACACT (2)
AACAGG (2)
AACCAC (2)
AAGAGC (2)
AAGCAG (2)
AAGGAG (2)
AAGTCG (2)
AATCAG (2)
AATCTG (2)
AATGAT (2)
ACAGAG (2)
ACCAGC (2)
ACCATC (2)
ACCGCC (2)
ACCTGC (2)
ACGAGG (2)
ACTCAG (2)
AGCATC (2)
AGCCGC (2)
AGCGAT (2)
AGGCGC (2)
AACCAG (26)
AACAGC (20)
AAGAGG (14)
AAGATG (12)
ACCAGT (8)
AACCGC (6)
ACCTGG (6)
ACTGCC (6)
AGGGCG (6)
AAAATG (5)
AAAAAG (4)
AACCAC (4)
AAGGTG (4)
AGAGCC (4)
AGCCTG (4)
AAGGAC (3)
AATGAC (3)
ACCAGC (3)
ACTGGC (3)
AGCCGG (3)
AGCGGG (3)
AAAAAT (2)
AAAAGC (2)
AAAAGG (2)
AAAATC (2)
AAAGAG (2)
AAAGAT (2)
AAAGGC (2)
AAATGC (2)
AACACC (2)
AACCCG (2)
AAGCAG (2)
AAGCCC (2)
AAGCTG (2)
AAGGAG (2)
AAGGGC (2)
AAGTAT (2)
AATCAG (2)
AATCTC (2)
AATGTC (2)
ACCGTC (2)
ACCGTG (2)
ACCTCC (2)
ACGCCG (2)
AGAGCT (2)
AGATCG (2)
AGCAGG (2)
AGCATC (2)
AGCCCC (2)
AGCCCG (2)
AGCCGC (2)
AGCTCC (2)
AGCTGC (2)
AGGGGG (2)
ATCCGC (2)
CCCCGG (2)
CCGGCG (2)

© Tóth, Gáspári, and Jurka (2000)