Simple sequence repeats longer than 12 bp
 
Simple sequence repeats in intergenic regions
(Top 100 % listed in the order of total length)
(Normalized total lengths [bp / 1 Mbp of DNA sequence] are shown in parentheses after each repeated motif.)
Length of
repeated
motif
(bp)
Taxonomic group
Primates Rodentia Mammalia Vertebrata Arthropoda C. elegans Embryophyta S. 
cerevisiae
Fungi  
1 A (3864)
C (16)
A (1956)
C (236)
A (1868)
C (86)
A (1612)
C (581)
A (1333)
C (129)
C (321)
A (252)
A (1975)
C (37)
A (3121)
C (19)
A (2024)
C (56)
2 AC (1049)
AT (329)
AG (327)
CG (4)
AC (3733)
AG (1799)
AT (363)
CG (33)
AC (2654)
AG (1766)
AT (246)
AC (2070)
AT (999)
AG (294)
AC (1159)
AT (663)
AG (437)
AG (353)
AC (249)
AT (219)
CG (1)
AT (1077)
AG (521)
AC (115)
CG (2)
AT (1552)
AC (266)
AG (57)
AT (279)
AC (140)
AG (136)
3 AAT (188)
AAC (115)
CCG (58)
AGG (45)
AAG (40)
AGC (25)
ACC (23)
ATC (19)
ACT (4)
AAG (280)
AGG (204)
AAT (168)
AAC (156)
AGC (154)
ACC (136)
CCG (88)
ATC (41)
ACT (3)
AGC (236)
CCG (90)
AAT (77)
AGG (56)
AAG (31)
AAC (28)
ACT (13)
AAT (497)
AGG (148)
ATC (112)
CCG (100)
AGC (84)
AAC (83)
AAG (50)
ACC (45)
ACT (8)
AAC (437)
AGC (255)
AAT (196)
ATC (75)
ACC (47)
AAG (36)
ACG (32)
AGG (32)
ACT (10)
CCG (8)
AAG (143)
AAT (98)
ATC (65)
ACC (23)
AGC (18)
AAC (16)
ACT (16)
ACG (14)
AGG (14)
CCG (7)
AAG (377)
AAT (198)
AAC (106)
ATC (88)
AGG (26)
ACC (21)
CCG (15)
ACT (14)
AGC (14)
ACG (10)
AAT (321)
ATC (49)
AGC (39)
ACT (36)
AAG (35)
AAC (23)
ACG (9)
AAT (162)
AAC (104)
AAG (84)
ACC (60)
ATC (43)
AGG (34)
ACT (30)
AGC (19)
CCG (8)
ACG (6)
4 AAAT (444)
AAAC (243)
AAAG (233)
AAGG (155)
AGAT (83)
AATG (69)
ATCC (68)
AGGG (51)
ACAT (25)
ACAG (19)
AATC (16)
AATT (9)
AGGC (8)
AAGC (7)
ACCC (7)
AACC (6)
ACTC (5)
ACCT (4)
AGCC (4)
CCCG (4)
ACGC (2)
ACGG (2)
AAAC (487)
AAAG (410)
AAAT (380)
AAGG (380)
AGAT (219)
ACAG (181)
AGGG (158)
ACAT (119)
AATG (95)
ATCC (66)
AACC (54)
AGGC (53)
ACCC (32)
ACCT (22)
ACGC (22)
AACT (21)
AAGC (21)
AATT (21)
ACTC (16)
AATC (15)
AGCC (12)
ACTG (9)
CCCG (8)
AAGT (6)
ACGG (5)
AGCG (4)
ACCG (3)
AACG (2)
AGCT (2)
AAGG (469)
AAAG (335)
AAAT (325)
ACAG (106)
CCCG (72)
AGGG (68)
AAAC (48)
AATG (27)
AAGT (17)
AATT (17)
AGAT (17)
ACCT (14)
ACTC (14)
AGAT (665)
ACAG (224)
AAAT (156)
ATCC (127)
AAGG (116)
ACAT (106)
AATG (67)
AGGG (58)
AAAC (54)
AAAG (54)
AATT (35)
AATC (29)
ACTC (17)
AGGC (17)
CCCG (17)
AACC (8)
ACGC (8)
AGCG (8)
ACAT (169)
AAAT (82)
AAAC (75)
AGCC (60)
ACAG (38)
AACC (31)
ACTG (29)
ATCC (27)
ACCG (19)
AATG (15)
AATC (13)
AGGC (11)
AAGT (9)
AGAT (9)
AACT (8)
ACGG (6)
AAGG (4)
AATT (4)
ACGC (4)
AGCG (4)
ATCG (4)
AAAT (85)
ACCT (20)
AGGC (19)
AAGT (17)
AAAC (13)
AAAG (7)
AATT (6)
ATCC (5)
AATC (4)
AATG (4)
ACTC (4)
ACAT (3)
ACGG (3)
AACC (2)
ACTG (2)
AACG (1)
AAGG (1)
AGCC (1)
ATGC (1)
AAAT (101)
AAAG (44)
AAAC (30)
AATT (20)
ACAT (20)
AGAT (19)
ATGC (9)
AATC (8)
AATG (7)
AAGC (6)
AACC (5)
AACT (5)
ACAG (4)
ACTC (4)
AGCT (4)
AAGG (3)
ACGT (3)
AGCC (2)
AGGG (2)
ATCG (2)
ACCG (1)
ACGG (1)
ACTG (1)
ATCC (1)
CCCG (1)
AAAT (118)
ACAT (46)
AAAC (35)
AAAG (24)
AATG (20)
AAGG (10)
AATT (10)
ACGT (5)
AGAT (5)
AAAT (114)
AAAG (66)
AAAC (28)
ATCC (21)
AATC (20)
AATG (20)
ACAT (18)
ACCT (18)
AAGT (14)
AGAT (14)
AACC (12)
AATT (11)
ACTC (11)
AGGC (11)
ACGC (10)
AAGG (8)
ACAG (6)
ACTG (6)
ACGG (4)
AACT (3)
AGCC (3)
AGGG (3)
5 AAAAC (310)
AAAAT (223)
AAAAG (142)
AAATG (34)
AGGGG (33)
CCCCG (27)
ACCCC (20)
AAAGG (19)
AAGGG (19)
AAATT (17)
AAGAG (15)
AGCCC (15)
AATAT (13)
AGAGG (13)
AGGGC (10)
AAACC (8)
ATCCC (7)
CCCGG (7)
AACAG (5)
AATAG (4)
AATTC (4)
AGCTC (4)
AAATC (3)
AATAC (3)
AAACT (2)
AAAGC (2)
AACAC (2)
AACTG (2)
AAGAC (2)
AATGT (2)
ACACC (2)
ACCTC (2)
AGAGC (2)
AGATG (2)
AGGCC (2)
CCGCG (2)
AAAGT (1)
AACAT (1)
AACCG (1)
AAGAT (1)
AATGC (1)
ACAGC (1)
ACAGG (1)
ACAGT (1)
ACCAG (1)
ACTCC (1)
AGCGC (1)
ATATC (1)
AAAAC (484)
AAAAG (125)
AAGAG (120)
AAAAT (104)
AGAGG (88)
AAAGG (78)
AAACC (56)
AGCTC (56)
ACCCC (51)
AAGGG (43)
CCCCG (43)
AGCCC (37)
AGGGG (35)
ACAGG (27)
AGGGC (20)
ATCCC (18)
AACTG (17)
AACAC (14)
AATAG (12)
ACACC (12)
ATATC (10)
AAGGC (9)
AATGT (9)
AGGCC (9)
AAAGC (7)
AACAG (7)
ACTCC (7)
CCCGG (7)
ACACT (6)
AAATC (4)
AAGAC (4)
AAGCC (4)
AATTC (4)
ACCAG (4)
AGGAT (4)
AGGCG (4)
CCGCG (4)
AAATT (3)
AGCGG (3)
AAACT (2)
AAAGT (2)
AAATG (2)
AAGAT (2)
AATAT (2)
ACATC (2)
ACATG (2)
ACCCT (2)
ACCTG (2)
ACTAG (2)
ACTCT (2)
AGAGC (2)
AGATC (2)
AGCCG (2)
AACTG (257)
AGCTC (171)
AGGGG (111)
AAAAC (77)
AAAAT (64)
AAGGG (56)
AAAGG (47)
AGCCC (47)
AGAGG (30)
AAGTG (26)
CCCCG (26)
AATAT (17)
AGATC (17)
AAAAG (13)
AAGAC (13)
AATAG (13)
AATCT (13)
AATGC (13)
ACCCC (13)
ACTGG (13)
AGCCG (13)
AGCGG (13)
AGGCC (13)
AGGGC (13)
ATCCC (13)
CCGCG (13)
AAAAT (156)
AAAAC (133)
AAGGG (133)
AGAGG (120)
CCCCG (88)
AGCGG (73)
AAAGG (60)
AATAT (55)
AGGGG (55)
CCCGG (44)
AAAAG (39)
AATCT (26)
AGCTC (21)
CCGCG (18)
AAAGT (16)
AAGCT (16)
ACATG (16)
ACGGG (16)
AGCAT (16)
AGCCG (16)
AAGAT (10)
AGATG (10)
AACAG (8)
AACGC (8)
AATCC (8)
ACACT (8)
ACTAT (8)
ACTGC (8)
AGGGC (8)
ATATC (8)
AAAAT (84)
AAAGT (76)
AAAAC (73)
AAATT (36)
ACACC (35)
AAATG (32)
AATCC (30)
ATCCG (30)
AAACG (28)
AAAAG (26)
AATAT (26)
AAACC (25)
AACTG (25)
ACAGC (22)
ACGAT (22)
AACAG (21)
ACTCC (21)
AAACT (18)
AAGTC (18)
AATGG (18)
AGAGC (18)
AAAGG (17)
AAATC (17)
AAGCC (14)
AAGGG (14)
ACCAT (14)
AGGCC (14)
ATATC (14)
AACCG (12)
AATCG (12)
AATGT (12)
AATTC (12)
ACAGG (12)
ACCCC (12)
ACGGG (12)
AGGCG (12)
AATAC (11)
AGCCC (11)
AGGGC (10)
AACAC (8)
AACAT (8)
AACGG (8)
AACGT (8)
AAGAG (8)
AAGAT (8)
AATAG (8)
ACATC (8)
ACCTC (8)
AGATC (8)
AGCCG (8)
AGGGG (8)
ATCCC (8)
CCCCG (8)
AAGCG (6)
AAGGT (6)
ACCAG (6)
AACCC (4)
AACGC (4)
AAGCT (4)
AAGTG (4)
AATCT (4)
ACACG (4)
ACAGT (4)
ACCGG (4)
ACGCG (4)
ACTAT (4)
ACTCG (4)
ACTGG (4)
AGAGG (4)
AGCGC (4)
ATCGC (4)
CCGCG (4)
AAAAT (68)
AAATT (54)
AAAAC (33)
AAAAG (22)
AAATG (19)
AATTC (14)
AAATC (11)
AATAC (11)
AATAT (5)
AAACT (4)
AAAGT (4)
AATAG (4)
AAACG (3)
AACAC (3)
AACAG (3)
AACTT (3)
ACAGT (3)
ACTAG (3)
ATATC (3)
AACAT (2)
AACCT (2)
AACTC (2)
AAGAG (2)
AAGGG (2)
AAGTC (2)
AATCC (2)
AATCG (2)
AATGT (2)
ACCCT (2)
ACTCT (2)
AGATC (2)
AGCCT (2)
ATCCC (2)
AAACC (1)
AACTG (1)
AAGTG (1)
AATCT (1)
AATGG (1)
ACGAG (1)
ACGCG (1)
ACTCG (1)
AGAGC (1)
AGATG (1)
AGCTC (1)
AGGGG (1)
AAAAT (236)
AAAAG (82)
AAAAC (80)
AAATT (48)
AAGAG (30)
AAACC (29)
AACAC (17)
AAATC (16)
AATAT (16)
AACCG (11)
AAATG (10)
AACTC (10)
ACCCG (10)
AAAGC (9)
AACAG (9)
AGAGG (9)
AACAT (7)
AACCC (7)
AATTC (7)
AAACT (6)
AAGAT (6)
AATGT (6)
AGATC (6)
AAGAC (5)
AATCC (5)
AATCG (5)
AGAGC (5)
AGATG (5)
AGGGG (5)
AACTT (4)
ACCCC (4)
ACCTC (4)
ACGGC (4)
ACTCT (4)
AAAGT (3)
AATAG (3)
AATCT (3)
ACCGG (3)
ACTGC (3)
AGCTC (3)
ATATC (3)
ATGCC (3)
AAGCC (2)
AAGTG (2)
AATGG (2)
ACAGC (2)
ACATC (2)
ACCAG (2)
ACGCC (2)
ATCCG (2)
AAACG (1)
AACGT (1)
AAGCT (1)
AAGGG (1)
AATAC (1)
AATGC (1)
ACACC (1)
ACACT (1)
ACAGG (1)
ACAGT (1)
ACATG (1)
ACCAT (1)
ACCTG (1)
ACGAT (1)
ACGCG (1)
ACTAT (1)
ACTCG (1)
ACTGG (1)
AGCAT (1)
AGCCC (1)
AGCGC (1)
AGGCG (1)
CCCGG (1)
CCGCG (1)
AAAAG (116)
AGATG (78)
AATAT (60)
AAAAC (44)
AAATG (20)
AACAC (18)
AATAG (14)
ACGAT (14)
AAACG (11)
AAGAT (11)
AAAAT (9)
AAACT (9)
AATGG (9)
ACACC (9)
ACATC (9)
ACTAT (9)
ACTCC (9)
AGCGG (9)
AGCTC (6)
AAATC (5)
AAGGG (5)
AATTC (5)
ACTGC (5)
AGAGG (5)
AGCCG (5)
AAAAT (202)
AAAAG (91)
AAATT (62)
AAAAC (52)
ACTAT (31)
AATAT (27)
AAACC (19)
AAAGG (18)
AAGAG (18)
AAAGC (17)
AAATC (16)
AATTC (16)
AATAC (15)
AATAG (14)
ATGCC (14)
ACTGG (12)
AAACT (11)
AACAC (11)
ACTGC (11)
ATATC (11)
AAATG (10)
ACTCT (10)
AGCCC (10)
AACCC (9)
AAGGC (9)
AGGGC (9)
AACAG (8)
AACCT (8)
AAGAC (8)
AATGT (8)
AGAGC (8)
ATCCC (8)
ACGAG (7)
AATCC (6)
AATCG (6)
ACGAT (6)
AGCAT (6)
AAACG (5)
AACCG (5)
AAGAT (5)
AAGCC (5)
AGAGG (5)
AGATG (5)
AGGAT (5)
AGGGG (5)
AAAGT (3)
AACGC (3)
AACTC (3)
AACTG (3)
AAGCG (3)
AAGCT (3)
AAGGG (3)
AAGTC (3)
AATGC (3)
AATGG (3)
ACACC (3)
ACACT (3)
ACAGC (3)
ACATC (3)
ACCAT (3)
ACCGC (3)
ACGCC (3)
ACGCG (3)
ACGTC (3)
ACTAG (3)
ACTCC (3)
ACTCG (3)
AGATC (3)
AGCCT (3)
AGCTC (3)
AGGCG (3)
ATCGC (3)
6 AAAAAC (117)
AAAAAT (78)
AAAAAG (45)
ACCCCC (15)
AGAGGG (13)
AGATAT (10)
CCCCCG (9)
AAGGAG (7)
AGGGGG (6)
CCCCGG (6)
AAGGGG (5)
ACAGAG (5)
AAGAGG (4)
AAAATT (3)
AAAGAG (3)
AAAGGG (3)
ACACCC (3)
AGCCCC (3)
CCCGCG (3)
AAAACC (2)
AAAAGG (2)
AAATAC (2)
AAATAT (2)
ACACGC (2)
ACAGGG (2)
ACATAT (2)
ACCATC (2)
ACCGCC (2)
AGAGGC (2)
ATCCCC (2)
AAAATG (1)
AAACCC (1)
AACAAG (1)
AACCCC (1)
AAGATC (1)
AAGGAT (1)
AAGGGC (1)
AATACC (1)
AATGAT (1)
ACACAG (1)
ACACAT (1)
ACCCCG (1)
ACCCTG (1)
ACCTCC (1)
ACGAGG (1)
ACTCTC (1)
ACTGCC (1)
AGATGG (1)
AGCCTC (1)
AGCGCC (1)
AGCGGC (1)
AGGCGC (1)
AGGGCC (1)
AGGGGC (1)
ATCCCG (1)
AGAGGC (130)
AAAAAC (95)
AGAGGG (74)
ACAGAG (69)
AAAAAG (34)
ACCCCC (32)
AGGGGC (25)
AAGGAG (21)
AAGAGG (18)
AAATAT (17)
AAAACC (14)
ACACAG (14)
AGCCCC (14)
AAAAAT (13)
AAAGGG (11)
AGGGGG (11)
ACACCC (10)
ACACAT (9)
AGGGCC (8)
AACTTG (7)
AAGCAG (7)
AGCATC (7)
ACACGC (5)
ACAGGC (5)
ACCATC (5)
ACGCGC (5)
AGCGGC (5)
AATGAG (4)
ACATAT (4)
ACATGC (4)
ACCGCC (4)
ACGAGG (4)
AGATCC (4)
AAGGGG (3)
ACAGAT (3)
ACCGCG (3)
ACCTCC (3)
ACTCCC (3)
ACTGGG (3)
AGAGAT (3)
AGAGCG (3)
AGCCGG (3)
AGCCTG (3)
AGCTGC (3)
AGGCCC (3)
AGGCCT (3)
AGGCGC (3)
AGGCGG (3)
CCCCCG (3)
CCCCGG (3)
AGAGCG (467)
ACACGC (293)
ACAGAG (103)
AAAAAC (46)
AAAGTG (46)
AACCTC (46)
CCCCCG (36)
ACCCCC (31)
ACAGCC (21)
AGGGGG (21)
AACAAG (15)
ACCTCC (15)
ACTGCT (15)
AACCCT (56)
AAAAAG (37)
AGCTCC (34)
AAAAAC (19)
AAAAAT (19)
ACACGC (19)
AATCTG (16)
AAGATT (12)
AAAACT (9)
AAAAGG (9)
AAAATT (9)
AACCTG (9)
AATCAC (9)
AATCAG (9)
ACAGAG (9)
ACAGCG (9)
ACCCCC (9)
ACCCTG (9)
ACGGGC (9)
AGAGCC (9)
ACAGAT (43)
AGCAGG (40)
AATACT (38)
AATTAC (28)
ACATCC (28)
AGCTCC (27)
AAACAG (23)
AAAATT (20)
AAAAAC (17)
AATAGT (17)
ACTCGC (17)
AAAAAT (15)
AACAAT (15)
AATCAG (15)
AATCCC (15)
AATGGG (15)
ACACGC (15)
ATCCGC (15)
ATGCCC (15)
AACAGT (13)
AACTGT (13)
AAAATG (12)
AAACTG (12)
AAAGGC (12)
AAATGG (12)
AATATG (12)
AATCGC (12)
ACTGCC (12)
AAAACG (10)
AAAACT (10)
AAAATC (10)
AAATAC (10)
AAATAT (10)
AAATCC (10)
AAATGC (10)
AACAGC (10)
AACGGG (10)
AAGCTG (10)
AAGGAC (10)
AAGTCC (10)
AATGCC (10)
AATGGT (10)
ACATAT (10)
ACATCT (10)
ACATGG (10)
ACCCAG (10)
ACGGAG (10)
ACGTCC (10)
AGGATG (10)
ATCCCC (10)
ATCCCG (10)
ATCGCC (10)
ACCATC (8)
AAAAGC (7)
AAATCT (7)
AAATTC (7)
ACGAGG (7)
ACGTAG (7)
AGATAT (7)
AGGGAT (7)
AAAACC (5)
AAACAC (5)
AAACTC (5)
AAAGAT (5)
AAAGTG (5)
AAATCG (5)
AAATTT (5)
AACAGG (5)
AACGCC (5)
AACGTC (5)
AACTAC (5)
AACTCC (5)
AAGATG (5)
AAGCGG (5)
AAGGTG (5)
AAGTCG (5)
AATACG (5)
AATCCG (5)
AATCGG (5)
AATCTG (5)
AATGCG (5)
AATGCT (5)
AATGGC (5)
AATTCC (5)
ACACTC (5)
ACAGAG (5)
ACAGGC (5)
ACAGTG (5)
ACATCG (5)
ACCACG (5)
ACCAGC (5)
ACCAGT (5)
ACCCAT (5)
ACCCGC (5)
ACCGAT (5)
ACGATG (5)
ACGCCC (5)
ACGGCG (5)
ACGGGC (5)
ACTCGG (5)
ACTGAG (5)
ACTGGC (5)
AGATCG (5)
AGATGG (5)
AGCATC (5)
AGCATG (5)
AGCCGG (5)
AGCTGC (5)
AGGCAT (5)
AGGCCC (5)
AGGCCG (5)
AGGGGC (5)
ATCATG (5)
AAGCCT (265)
AGGCAT (41)
AAAAAT (30)
ACCTAT (22)
AGCCTG (20)
ACATAT (15)
AAAACG (13)
AAAATT (11)
AAATTG (9)
AAATTT (7)
AAAAAG (6)
AAAAAC (4)
AAAATG (4)
AAAGCC (4)
AAATTC (4)
AAGCAT (4)
AAGTCT (4)
AATCAT (4)
AAAACC (3)
AAAATC (3)
AAAACT (2)
AAACAC (2)
AAACAG (2)
AAACCT (2)
AAATAC (2)
AAATAT (2)
AACTAG (2)
AAGATG (2)
AAGCCG (2)
AAGGAT (2)
AATCAG (2)
ACCCCG (2)
ACCTAG (2)
AGCTCC (2)
AAAAGC (1)
AAAAGG (1)
AAAAGT (1)
AAACGG (1)
AAACTG (1)
AAACTT (1)
AAAGAG (1)
AAAGAT (1)
AAAGGT (1)
AAAGTC (1)
AAAGTT (1)
AAATAG (1)
AAATCT (1)
AAATGT (1)
AACAAG (1)
AACACC (1)
AACACG (1)
AACAGC (1)
AACCAT (1)
AACCCG (1)
AACCTG (1)
AACCTT (1)
AACGAC (1)
AACGTG (1)
AACTCT (1)
AACTGG (1)
AAGAAT (1)
AAGACC (1)
AAGACG (1)
AAGCAC (1)
AAGCTC (1)
AAGCTT (1)
AAGGAG (1)
AAGTAG (1)
AAGTCG (1)
AAGTGG (1)
AATACT (1)
AATAGT (1)
AATATC (1)
AATATT (1)
AATCCT (1)
AATCTG (1)
AATGAG (1)
AATGAT (1)
AATGGT (1)
AATTAG (1)
AATTAT (1)
AATTCC (1)
AATTCG (1)
ACACAG (1)
ACACAT (1)
ACAGTC (1)
ACATCC (1)
ACATCT (1)
ACATGC (1)
ACATGG (1)
ACCCAT (1)
ACCGCC (1)
ACCGGC (1)
ACCGTG (1)
ACCTCC (1)
ACGAGG (1)
ACGTCC (1)
ACTCAG (1)
ACTCCC (1)
ACTCTC (1)
ACTGCT (1)
AGAGCC (1)
AGAGGC (1)
AGAGGG (1)
AGGGGG (1)
ATCCCG (1)
CCCGCG (1)
AAAAAT (50)
AAAAAC (32)
AAAAAG (23)
AAGAGG (9)
AACCCG (8)
AAAACC (7)
AAAATT (7)
AAAGAG (7)
AAGATG (7)
AAAATC (6)
AAAGCC (6)
AAATAT (5)
AATCAG (5)
ACATAT (5)
AGATGG (5)
AAAACT (4)
AAACAC (4)
AAACCG (4)
AAACGG (4)
AACAAG (4)
AACAAT (4)
ACCCCC (4)
AGAGAT (4)
AGAGGG (4)
AGCCCG (4)
AAACGC (3)
AATACC (3)
AATCCC (3)
AGGGGC (3)
AAACAG (2)
AAAGTG (2)
AAAGTT (2)
AAATAC (2)
AAATCG (2)
AAATTC (2)
AAATTT (2)
AACACC (2)
AACCAC (2)
AACTGT (2)
AAGCAC (2)
AAGCAG (2)
AAGTGG (2)
AATATC (2)
AATATG (2)
AATCTC (2)
AATGAG (2)
AATGAT (2)
ACAGAG (2)
ACATGC (2)
AGATAT (2)
AGCCGG (2)
ATCATG (2)
AAAAGC (1)
AAAAGG (1)
AAAAGT (1)
AAACCC (1)
AAAGGC (1)
AAATAG (1)
AAATCC (1)
AAATGC (1)
AAATGG (1)
AAATTG (1)
AACAGT (1)
AACATC (1)
AACATG (1)
AACCCT (1)
AACCGC (1)
AACCTG (1)
AAGACC (1)
AAGACG (1)
AAGATC (1)
AAGCCC (1)
AAGGAG (1)
AATACT (1)
AATCAC (1)
AATCAT (1)
AATCGC (1)
AATGCT (1)
AATGGG (1)
AATGGT (1)
AATGTC (1)
AATTAC (1)
AATTAG (1)
AATTAT (1)
ACACAT (1)
ACAGAT (1)
ACAGTC (1)
ACATCT (1)
ACCACG (1)
ACCACT (1)
ACCATC (1)
ACCCGC (1)
ACCCGT (1)
ACCTCC (1)
ACGGAG (1)
ACGGCG (1)
ACGTAT (1)
ACTAGT (1)
ACTCCG (1)
AGCCCC (1)
AGCGCC (1)
AGCGGG (1)
AGCTGC (1)
AGGATC (1)
AGGGGG (1)
CCCGCG (1)
ACACCC (119)
AAAAAC (57)
AAAAAT (57)
AAAAAG (33)
AACAAG (27)
AAAATG (16)
AAAATT (16)
AACAGC (16)
ACATAT (16)
AATCAT (15)
AAATAC (11)
AACAAT (11)
AAGCGG (11)
AATATC (11)
ACACAG (11)
ACTCCG (11)
AGAGCC (11)
AACGAC (7)
AAGACG (7)
AAGAGG (7)
ACAGCG (7)
AAACAG (5)
AAGCAG (5)
AATGAC (5)
AATTAG (5)
AATTAT (5)
ACACGC (5)
ACACTC (5)
ACAGAG (5)
ACTATC (5)
AGCATC (5)
ATCCCG (5)
AAAAAT (134)
AAAAAC (23)
AAAAAG (16)
AAATAG (16)
ACCCCC (10)
AAAAGG (9)
AAAGAG (9)
AAATAT (9)
AAATTT (9)
AAGATG (9)
AATGTG (9)
ACCCGC (9)
AGCCTG (9)
AAAATT (7)
AAAAGC (6)
AAACAG (6)
AAATTG (6)
AACACC (6)
AACCAC (6)
AAGTAT (6)
AATATT (6)
AATGAT (6)
ACATAT (6)
ACCAGT (6)
ACGGCG (6)
AGAGCG (6)
AGAGGG (6)
AGCAGG (6)
AGGGGG (6)
ATATGC (6)
AAGGAG (5)
AAGTGG (5)
AAACAT (4)
AACGGG (4)
AATAGC (4)
AATCAC (4)
AATTCC (4)
ACTCGC (4)
AGAGCT (4)
AGCTCC (4)
AAAACC (3)
AAAACG (3)
AAAACT (3)
AAAAGT (3)
AAAATC (3)
AAACAC (3)
AAACCC (3)
AAACTG (3)
AAAGCC (3)
AAAGTG (3)
AAATGG (3)
AAATTC (3)
AACAAG (3)
AACACT (3)
AACAGC (3)
AACATC (3)
AACATT (3)
AACGGC (3)
AAGACG (3)
AAGCAG (3)
AAGCTG (3)
AAGGGC (3)
AAGTAC (3)
AATATG (3)
AATCCT (3)
AATGGG (3)
AATTAC (3)
AATTAG (3)
ACACGC (3)
ACAGAG (3)
ACATGC (3)
ACCAGC (3)
ACCATC (3)
ACCCTC (3)
ACCCTG (3)
ACCTCC (3)
ACGGGC (3)
ACGTAG (3)
ACTAGT (3)
ACTCCT (3)
ACTCTC (3)
ACTGAG (3)
AGAGGC (3)
AGATAT (3)

© Tóth, Gáspári, and Jurka (2000)