Simple sequence repeats
 
Expandability of simple sequence repeats in introns
(total length of SSRs longer than 24 bp / total length of SSRs longer than 12 bp [%])
Repeated
motif
Taxonomic group
Primates Rodentia Mammalia Vertebrata Arthropoda C. elegans Embryophyta S. 
cerevisiae
 Fungi 
A15.620.010.210.09.63.95.212.729.7
C000001.7000
AC62.479.263.663.918.737.110.7074.4
AG31.379.023.254.120.037.643.9018.6
AT42.155.043.554.522.051.843.440.123.2
CG000--0---
AAC14.927.625.325.70014.0-29.0
AAG24.289.10005.719.300
AAT35.775.2043.127.19.040.638.769.8
ACC35.739.8-0000-0
ACG----00-0-
ACT50.0100.0--0056.30-
AGC057.00010.300-60.2
AGG25.643.100025.057.1-0
ATC23.123.8-003.817.5-73.6
CCG0---000-0
AAAC13.321.4032.807.70-0
AAAG44.473.1062.9-011.4-0
AAAT39.355.433.356.0017.2000
AACC35.747.4-100.0-00--
AACG0----0---
AACT-0--000--
AAGC060.50---0--
AAGG44.570.076.50100.00---
AAGT00---00--
AATC31.377.3-54.500000
AATG12.341.70000---
AATT00-0000-0
ACAG050.5061.200--0
ACAT7.172.2-019.2020.00-
ACCC025.0--0---60.5
ACCG---------
ACCT50.00---48.5--0
ACGC058.1-0--0--
ACGG-0--0---0
ACGT0-----00-
ACTC00-100.0--0--
ACTG0100.0--00---
AGAT70.783.1-71.1000--
AGCC000--0---
AGCG-100.0-00-0-0
AGCT0-----0--
AGGC22.243.500000--
AGGG11.149.768.611.7--0--
ATCC52.180.5062.2-00--
ATCG---------
ATGC0-----0--
CCCG061.5------0
CCGG0--------
AAAAC20.217.466.90006.042.30
AAAAG6.851.000009.800
AAAAT23.155.2021.803.4000
AAACC33.346.00-000--
AAACG----00100.0--
AAACT0--0000--
AAAGC00--0-0-0
AAAGG41.90---00-0
AAAGT0----0---
AAATC0--0012.50--
AAATG0---000-0
AAATT5.000-20.811.7000
AACAC00---00100.0-
AACAG0--0--0--
AACAT0---000--
AACCC053.8----0--
AACCG----0-0--
AACCT-----00--
AACGC---------
AACGG---000---
AACGT---------
AACTC-----0---
AACTG0-49.6--00--
AACTT---0-00-0
AAGAC-0--00---
AAGAG0100.0--000-0
AAGAT0-0-000-0
AAGCC0----0---
AAGCG---------
AAGCT0--------
AAGGC00-------
AAGGG12.542.9---00-0
AAGGT-----100.0---
AAGTC---------
AAGTG0----00--
AATAC0---010.00-0
AATAG33.30-0-0---
AATAT059.3100.00016.7000
AATCC----00---
AATCG----000--
AATCT0---0-0--
AATGC----000--
AATGG0----00--
AATGT-0-0000-0
AATTC0--0-044.4-0
ACACC--------0
ACACG-0-------
ACACT0---0----
ACAGC0100.0-0-0--0
ACAGG00-0-----
ACAGT000--00--
ACATC0--00-0--
ACATG-0---00--
ACCAG100.00--0----
ACCAT-0--0-0--
ACCCC7.10------0
ACCCG------0--
ACCCT-0---00--
ACCGC---0-0---
ACCGG------0--
ACCGT-----0---
ACCTC-100.0-0--0--
ACCTG-0-------
ACGAG---------
ACGAT----0-66.7--
ACGCC------0-0
ACGCG-----0---
ACGCT---------
ACGGC---------
ACGGG---------
ACGTC-----0---
ACTAG0----00--
ACTAT0--000---
ACTCC42.90--00-0-
ACTCG---------
ACTCT-----0---
ACTGC66.7--0--0--
ACTGG-0--0-0--
AGAGC063.0-00-0--
AGAGG47.862.5100.00-----
AGATC0--0-00--
AGATG------000
AGCAT-0-------
AGCCC070.4-0-----
AGCCG----0----
AGCCT---0-100.00--
AGCGC0--0-----
AGCGG0---00---
AGCTC0100.0-0-00--
AGGAT0--------
AGGCC00--0----
AGGCG0--------
AGGGC7.1--0-----
AGGGG13.258.500000-32.9
ATATC-100.0---00--
ATCCC0---100.00---
ATCCG----55.6----
ATCGC-----00--
ATGCC0----071.4--
CCCCG9.40-0--0--
CCCGG0--0-----
CCGCG---------
AAAAAC7.122.029.2000074.5-
AAAAAG000--00050.7
AAAAAT2.90-0000-23.2
AAAACC0----00--
AAAACG-----0---
AAAACT0-----0--
AAAAGC-----0---
AAAAGG0----0---
AAAAGT-----0---
AAAATC0----00--
AAAATG-----0100.0--
AAAATT0----5.6100.0-0
AAACAC-0--000-0
AAACAG0---00---
AAACAT---------
AAACCC---------
AAACCG---------
AAACCT-----40.00--
AAACGC---------
AAACGG----0----
AAACGT---------
AAACTC---------
AAACTG-----0---
AAACTT-----0---
AAAGAC------0--
AAAGAG0100.0----0--
AAAGAT------0--
AAAGCC-----66.7---
AAAGCG---------
AAAGCT---------
AAAGGC---------
AAAGGG00-------
AAAGGT-----0---
AAAGTC---------
AAAGTG---------
AAAGTT-----0---
AAATAC66.7--------
AAATAG-----0---
AAATAT75.0---00---
AAATCC0---0----
AAATCG----0----
AAATCT---------
AAATGC----000--
AAATGG------0--
AAATGT---------
AAATTC-----0---
AAATTG-----0---
AAATTT0---00---
AACAAG---------
AACAAT-----0---
AACACC-----0---
AACACG---------
AACACT---------
AACAGC0--------
AACAGG----0----
AACAGT----0----
AACATC----0---0
AACATG-----0--0
AACATT---------
AACCAC---------
AACCAG---------
AACCAT------0--
AACCCC0--------
AACCCG------0--
AACCCT-100.000-0---
AACCGC---------
AACCGG---------
AACCGT---------
AACCTC---------
AACCTG---------
AACCTT---------
AACGAC---------
AACGAG---------
AACGAT---------
AACGCC-----0---
AACGCG---------
AACGCT---------
AACGGC----0----
AACGGG---0-----
AACGGT---------
AACGTC---------
AACGTG---------
AACGTT---------
AACTAC-----0---
AACTAG---------
AACTAT----00---
AACTCC----0----
AACTCG--------0
AACTCT---------
AACTGC---------
AACTGG---------
AACTGT-----0---
AACTTC---------
AACTTG------0--
AAGAAT0--------
AAGACC----0----
AAGACG---------
AAGACT-----100.0---
AAGAGC---------
AAGAGG100.00-------
AAGAGT---------
AAGATC----0----
AAGATG-----00--
AAGATT---------
AAGCAC---------
AAGCAG-0---0---
AAGCAT-----0---
AAGCCC-----50.0---
AAGCCG-----0---
AAGCCT-----19.3---
AAGCGC---------
AAGCGG---------
AAGCGT-----0---
AAGCTC---------
AAGCTG---------
AAGCTT-----0---
AAGGAC---------
AAGGAG33.375.0-------
AAGGAT---------
AAGGCC---------
AAGGCG---------
AAGGCT---------
AAGGGC---------
AAGGGG25.00-------
AAGGGT---------
AAGGTC0--------
AAGGTG---------
AAGTAC---------
AAGTAG----00---
AAGTAT---------
AAGTCC---------
AAGTCG---------
AAGTCT-----0---
AAGTGC---------
AAGTGG----0----
AAGTGT---------
AATACC----0-0--
AATACG---------
AATACT----76.6----
AATAGC---------
AATAGG-----0---
AATAGT0--100.0-0-0-
AATATC---------
AATATG---------
AATATT-0----0--
AATCAC------54.5--
AATCAG---------
AATCAT0------100.0-
AATCCC----0----
AATCCG---------
AATCCT0--------
AATCGC------0--
AATCGG---------
AATCGT---------
AATCTC---------
AATCTG----0-0--
AATGAC-----0-0-
AATGAG--0------
AATGAT-100.0----0-0
AATGCC-----0---
AATGCG----0---0
AATGCT---------
AATGGC------0--
AATGGG----0----
AATGGT---------
AATGTC-----0---
AATGTG----0----
AATTAC----00---
AATTAG---------
AATTAT0----0---
AATTCC---------
AATTCG---------
AATTGC---------
ACACAG054.50------
ACACAT079.2--00---
ACACCC0-100.0-----0
ACACCG---------
ACACCT-----100.0---
ACACGC0--0---0-
ACACGG---------
ACACGT------0--
ACACTC0--------
ACACTG---------
ACAGAG032.5-------
ACAGAT----0----
ACAGCC-035.4-0----
ACAGCG---------
ACAGCT---000---
ACAGGC-0--0----
ACAGGG0-------100.0
ACAGGT---------
ACAGTC----0----
ACAGTG-0-------
ACATAG---------
ACATAT50.088.0--066.7-0-
ACATCC---------
ACATCG---------
ACATCT---------
ACATGC---------
ACATGG0-----0--
ACATGT---------
ACCACG---------
ACCACT---------
ACCAGC-0-------
ACCAGG-----0---
ACCAGT--------0
ACCATC100.0--------
ACCATG-0--0----
ACCCAG-0-------
ACCCAT---------
ACCCCC000---0-0
ACCCCG-0---0---
ACCCCT---------
ACCCGC---------
ACCCGG--0------
ACCCGT---------
ACCCTC0---0----
ACCCTG0-------0
ACCGAG---------
ACCGAT---------
ACCGCC0---0----
ACCGCG---------
ACCGCT---------
ACCGGC---------
ACCGGG---------
ACCGGT---------
ACCGTC---------
ACCGTG---------
ACCTAG-----70.0---
ACCTAT0----0---
ACCTCC0----00--
ACCTCG-----0---
ACCTCT-0-------
ACCTGC---------
ACCTGG---------
ACGACT---------
ACGAGC---------
ACGAGG---------
ACGAGT---------
ACGATC---------
ACGATG----0----
ACGCAG---------
ACGCAT---------
ACGCCC---------
ACGCCG---------
ACGCCT---------
ACGCGC00-------
ACGCGG------0--
ACGCGT---------
ACGCTC---------
ACGCTG----100.0----
ACGGAG---------
ACGGAT----0----
ACGGCC---------
ACGGCG---------
ACGGCT---------
ACGGGC---------
ACGGGG---------
ACGTAG---------
ACGTAT------0--
ACGTCC----0----
ACGTCG---------
ACGTGC---------
ACTAGC---------
ACTAGG----0----
ACTAGT---------
ACTATC---------
ACTATG---------
ACTCAG---------
ACTCAT---------
ACTCCC---------
ACTCCG---------
ACTCCT---------
ACTCGC---------
ACTCGG---------
ACTCTC---------
ACTCTG---------
ACTGAG---------
ACTGAT----89.5----
ACTGCC0--------
ACTGCG---------
ACTGCT---------
ACTGGC---------
ACTGGG---------
AGAGAT-100.0-------
AGAGCC-----0--0
AGAGCG---------
AGAGCT-0----0--
AGAGGC-77.1100.0---0--
AGAGGG25.0-0-0----
AGATAT60.081.3--0----
AGATCC---------
AGATCG-70.6-------
AGATCT---------
AGATGC---------
AGATGG----0----
AGCAGG-----0---
AGCATC---------
AGCATG----0-0--
AGCCAT---------
AGCCCC23.153.8-------
AGCCCG---------
AGCCCT---------
AGCCGC---------
AGCCGG-0-------
AGCCTC0----0---
AGCCTG0----41.70--
AGCGAT---------
AGCGCC---------
AGCGCG---------
AGCGCT---------
AGCGGC---------
AGCGGG-----0---
AGCTAT---------
AGCTCC----00---
AGCTCG---------
AGCTGC---------
AGGATC---------
AGGATG---------
AGGCAT-----50.0---
AGGCCC0--------
AGGCCG---------
AGGCCT-----0---
AGGCGC---------
AGGCGG------0--
AGGGAT---------
AGGGCC0-0------
AGGGCG---------
AGGGGC00--0---100.0
AGGGGG00--00--0
ATATCC---------
ATATCG---------
ATATGC---------
ATCATG---------
ATCCCC0---0----
ATCCCG---------
ATCCGC---------
ATCCGG---------
ATCGCC---------
ATCGCG---------
ATCGGC---------
ATGCCC---------
ATGCGC---------
ATGGCC---------
CCCCCG00-------
CCCCGG000------
CCCGCG---------
CCCGGG---------
CCGCGG---------
CCGGCG---------

© Tóth, Gáspári, and Jurka (2000)